Zusammenfassung der Ressource
La evidencia morfológica y molecular respalda el reconocimiento
específico de la extinta Bettongia anhydra (Marsupialia: Macropodidae)
- METODOLOGÍA
- Análisis morfológico
- Examinación y comparación del holotipo B.
anhydra para determinar afinidades
taxónomicas
Anmerkungen:
- Holotipo B. anhydra (SAM M3582) se comparó con especímenes representativos de otras especies de Bettogonia.
- Nomenclatura y taxonomía de grupos familiares
- Prideaux (2004) y
Predeaux &
Warburton (2010)
- Abreviaturas a tener en cuenta
- FUR = colección de referencia de la Universidad de
Flinders de Australia del Sur; SAM = Museo del
sur de Australia (M: colección de mamíferos; P:
colección paleontológica); WAM = colección
paleontológica del Museo de Australia Occidental;
QM = colección de mamíferos del Museo de
Queensland.
- Análisis genético
- Muestra del hueso turbinal izquierdo de la
cavidad nasal del cráneo de holotipo B. anhydra
Anmerkungen:
- Se realizó con pinzas estériles y luego se colocó en un vial estéril marcado.
- Se escogió esta parte porque se encuentra protegida en gran medida de la contaminación al estar dentro de la cavidad nasal.
- Extracción de ADN
- Muestra triturada en polvo y almacenada
para su extracción y amplificación
- Tampón de digestión ósea
- Consistió en
- Ditiotreitol 10 mM
- Ácido etilendiaminotetraacético 0,48 M
- Polvo de proteinasa K 1 mg / ml
- Tris 20 mM pH 8.0
- 1% Triton X-100
- Se añadió un total de 1.500 µl de tampón de
digestión ósea al polvo de hueso y se incubó
durante la noche a 55ºC con rotación
- Se centrifugó a 13.000xg durante 1 minuto
Anmerkungen:
- Se realiza con el fin de granular el material no digerido.
- Análisis de ADN
- Análisis filogenético
- Visualización mediante FIGTREE
- Verificación mediante TRACER
- Mediante el programa filogénetico BEAST
- Mediante conjunto de ceebadores
diseñados que se dirigen al gen del
citocromo b para Bettongia
Anmerkungen:
- Conjuntos de cebadores woylie_cytb_139F ACCTTCCAACATTTGAGCCTGATG y woylie_cytb_388R TGAGCCGTAGTAGATTCCTC se usaron para dirigir una región de ~ 200 pares de bases de ADN del citocromo b.
- Se completó un volumen de 25L
para cada qPCR
Anmerkungen:
- Reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (qPCR).
Contiene 12,5 l ABI Potencia SYBR mezcla maestra (Applied Biosystems, Waltham, Massachusetts), 0,4? M de cebador directo y reverso, 8,5 M H 2 O, y 2 µl de extracto de ADN
- El ADN de calidad se preparó para una
secuenciación de Sanger
Anmerkungen:
- Se crearon múltiples conjunto de datos de secuencia.