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Beschreibung
Mindmap von Edgar Alvarez, aktualisiert more than 1 year ago
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Erstellt von Edgar Alvarez
vor mehr als 9 Jahre
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Introduce el texto aquí
- Dada una secuencia se hizo un
alineamiento con BLAST con el
fin de darnos un panorama de la
secuencia con la que
trabajaríamos.
- Luego se analizo dicha
secuencia con las
herramientas
bioinformáticas apropiadas
(ORF finder, Star ORF, Gene
id y GENESCAN)
- Se comparó cada
resultado de dichos
programas y con esto se
determino los posibles
Marcos de lectura.
- Luego estos marcos de lectura
fueron analizados con BLAST
para determinar si realmente
tenia alguna función o no
- Se reviso cuidadosamente las
secuencias y archivos enlazados a
estas secuencias que producían
alineamientos significativos
- Con ello se logro identificar a
que organismo pertenecía
dicha secuencia, cual era la
función, que proteína producía
y que gen era el responsable
de todo esto.
- Para generar el mapa hipotético de la
secuencia así como para obtener la secuencia
de cDNA de los ORFs obtenidos fue necesario
hacer un alineamiento con ClustalW2 el cual
ayudo a aclarar la posición de los exones
dados con cada herramienta así como para
poder comparar los marcos de lectura dados
con cada herramienta así fue como se pudo
determinar in silico el mapa de la secuencia.
- Para generar el mapa hipotético de la
secuencia así como para obtener la secuencia
de cDNA de los ORFs obtenidos fue necesario
hacer un alineamiento con ClustalW2 el cual
ayudo a aclarar la posición de los exones
dados con cada herramienta así como para
poder comparar los marcos de lectura dados
con cada herramienta así fue como se pudo
determinar in silico el mapa de la secuencia.
- Con ello se logro identificar a
que organismo pertenecía
dicha secuencia, cual era la
función, que proteína producía
y que gen era el responsable
de todo esto.
- Se reviso cuidadosamente las
secuencias y archivos enlazados a
estas secuencias que producían
alineamientos significativos
- Luego estos marcos de lectura
fueron analizados con BLAST
para determinar si realmente
tenia alguna función o no
- Se comparó cada
resultado de dichos
programas y con esto se
determino los posibles
Marcos de lectura.
- Luego se analizo dicha
secuencia con las
herramientas
bioinformáticas apropiadas
(ORF finder, Star ORF, Gene
id y GENESCAN)
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