Bakterija koja ne može sintetizirati histidin je:
auksotrof
prokariot
autotrof
prototrof
ništa od navedenog
Izoshizomeri su restrikcijski enzimi koji:
prepoznaju različite slijedove, a kreiraju iste krajeve
prepoznaju iste slijedove, ali ne kidaju nužno na istom mjestu
kreiraju isključivo 5' istaknute krajeve
kreiraju isključivo 3' istaknute krajeve
Koji se enzim koristi za združivanje fragmenata nastalih razgradnjom restrikcijskih enzima?
EcoRI
DNAp
DNA metilaza
lizozim
DNA ligaza
Prilikom izolacije genomske DNA etanol služi za:
lizu stanica
taloženje DNA
denaturaciju DNA
denaturaciju proteina
uklanjanje RNA
Otopina CaPO4 koristi se za:
transfekciju stanica sisavaca
transformaciju kvasaca
transformaciju bakterija
elektroporaciju
ništa od navedenog nije točno
Što od navedenog nije dio lac operona?
gen za represor
gen za aktivator
strukturni geni
promotor
operator
Želimo li lančanom reakcijom polimeraze ispitati postojanje dvaju udaljenih različitih mutacija u istom uzorku, te dvije reakcije razlikovat će se:
u temperaturi pri kojoj se odvija produljivanje početnica (sinteza nove DNA)
u DNA koja služi kao kalup
u koncentracijama Mg, dNTP, DNAp
u slijedu nukleotida početnica
sve navedeno je točno
O intronima je netočno:
introne nalazimo i u biljnim i u životinjskim genima
introni se ne prepisuju u RNA
introni se uklanjaju prekrajanjem RNA
introne primarno nalazimo u eukariotskim genima
intronski slijedovi ne kodiraju za proteinski produkt
Kod pripreme i održavanja staničnih kultura možemo zanemariti:
temperaturu
postotak CO2 u inkubatoru
postotak vlage u inkubatoru
postotak N2 u inkubatoru
količinu hranjive tvari
Svaki vektor za kloniranje mora imati:
ishodište replikacije, promotor i mjesto za kloniranje
selektivni biljeg, promotor i mjesto za kloniranje
selektivni biljeg, ishodište replikacije, mjesto za kloniranje i promotor
selektivni biljeg, ishodište replikacije, mjesto za kloniranje i afinitetnu oznaku
selektivni biljeg, ishodište replikacije i mjesto za kloniranje
Zanamavir i Oseltamivir su:
virusi ptičje gripe
inhibitori RT koji se koriste u liječenju HIVa
analozi sijalinske kiseline koji onemogućuju razmnožavanje virusa influence
monoklonska protutijela koja blokiraju reverznu transkripciju virusa influence
Ura3 je:
selektivni biljeg za bakterijske stanice
selektivni biljeg za kvasac
selektivni biljeg za stanice sisavaca
kvaščev shuttle vektor
shuttle vektor za stanice sisavaca
U sustavu pET gen za T7 RNA polimerazu nalazi se:
u vektoru pET
u genomu E. coli
u mediju za uzgoj bakterija
na plazmidu E. coli
vezan za IPTG
Acetilacija histonskih repova utječe na:
omjer A/T i G/C parova u DNA
pozitivan naboj Lys prevodi se u neutralan što značajno umanjuje afinitet vezanja DNA
omogućuje razlikovanje deaminiranog citozina
pozitivan naboj octene kiseline potiče odbijanje od fosfatne skupine okosnice DNA
Što od navednog dobro definira redoslijed faza staničnog ciklusa?
G1 -> G2 -> S -> mitoza -> citokineza
G1 -> S -> G2 -> mitoza -> citokineza
citokineza -> mitoza -> G1 -> S -> G2
mitoza -> G1 -> G2 -> S -> citokineza
G2 -> G1 -> mitoza -> S -> citokineza
Što je od navedenog točno?
N-glikozilacija počinje u Golgijevom aparatu
O-glikozilacija počinje u ER
N- vezani šećeri se dodaju na Leu
O-vezani šećeri se dodaju na Ser ili Thr
O-vezani šećeri se dodaju na Tyr
Ciklini tipa D:
se sintetiziraju samo u G2 fazi staničnog ciklusa
omogućuju stanici da prođe kroz restrikcijsku točku u G1 fazi
zajedno s protein kinazom Cdc2 tvore faktor poticanja sazrijevanja MPF
sintetiziraju se pri kraju M faze
nakon aktivacije počinje ulazak stanice u M fazu staničnog ciklusa
HIV-1:
je retrovirus koji svoju genetičku informaciju pohranjuje u molekuli DNA
je rinovirus koji svoju genetičku informaciju pohranjuje u molekuli RNA
je transpozon koji svoju genetičku informaciju pohranjuje u molekuli RNA
ne sadrži genetičku informaciju
Tijekom citokineze biljnih stanica, stanična ploča nastaje fuzijom mikrotubula i vezikula koje potječu od:
mitohondrija
kontraktilnog prstena
stanične membane
Golgijevog kompleksa
stanične stijenke
Najučinkovitija metoda prijenosa DNA u genskoj terapiji danas je:
unos iglom i špricom
unos putem genskog pištolja
unos liposoma
unos putem genetički modificiranih virusa
elektrofuzija
PAC ne sadrži:
selektivni biljeg
dva loxP mjesta
gen cre
pac mjesto
cAMP je:
supstrat za adenil ciklazu
produkt djelovanja cAMP fosfodiesteraze na AMP
regulator djelovanja fosfolipaze A
faktor rasta
Kapsomera je:
prionski protein
nukleokapsida
viroid
proteinska podjedinica kapside
izvanstanični oblik virusa
GenBank je:
baza nukleotidnih slijedova
baza prostornih struktura bioloških makromolekula
baza literaturnih podataka
baza mutacija u genu p53
baza aminokiselinskih slijedova
U kvaščevom sustavu dvaju hibrida kao gen izvjestitelj prisutan je:
amp4
leu2
lacZ
trp1
svi odgovori su točni
Nasumična mutageneza ne provodi se:
uporabom specifičnih kemikalija
uporabom bakterijskog soja mutatora
nehomolognom rekombinacijom
homolognom rekombinacijom
transpozonima
Amplifikacija staničnog signala ne uključuje:
drugi glasnik
signalnu molekulu
kaskadu protein kinaza
replikaciju DNA
receptor za signalnu molekulu
Viroidi su:
virioni
linearne molekule RNA
inaktivni bez kapside
reda veličine genoma manjih virusa
uzročnici bolesti gljiva
U plavo bijeloj selekciji, kolonije koje sadže prazni plazmid uzgajane na podlozi IPTG i X-Gal:
imat će funkcionalnu galaktozidazu
imat će inaktivnu galaktozidazu
biti će plave boje
biti će bijele boje
neće narasti na navedenoj podlozi
O kaspazama je netočno:
su tirozinske proteaze
sudjeluju u procesu apoptoze
kidaju peptidnu vezu iza Glu
sintetiziraju se kao inaktivne preteče
inaktiviraju se putem IAP i Bcl-2
Rekombinantnu molekulu dobit ćemo:
ugradnjom virusne DNA u genom domaćina
prebacivanjem transpozona s jednog kromosoma na drugi
ugradnjom ljudskog gena u restrikcijsko mjesto faga lambda
u profazi mitoze
u profazi prve mejotičke diobe
Što od navedenog je točno?
N-vezani šećeri se dodaju na Leu
O apoptozi je točno:
u procesu apoptoze sudjeluju kaspaze
apoptoza ne izaziva upalni odgovor
za odvijanje apoptoze je potrebna energija
u apoptozi sudjeluju proteini iz porodice Bcl
stanice imunosnog sustava nikad ne umiru apoptozom
O N-vezanim glikanima je netočno:
uvijek se povezuju sa Ser ili Thr u sklopu slijeda Asn-x-Ser/Thr
sve glikoziltransferaze uključene u sintezu zajedničke preteče koriste nukleotidne šećere kao donore monosaharida
N-glikozilacija počinje u Golgiju
N-glikozilacija počinje u ER
N-vezani šećeri se vežu na Asn u sklopu slijeda Asn-x-Ser/Thr
Herceptin je:
isto što i trastuzumab
isto što i infliximab
monoklonsko protutijelo
hormon kojeg proizvode stanice raka
kimerno protutijelo
Uvođenje rekombinantne DNA u bakterijsku stanicu posredovanjem kratkog električnog pulsa nazivamo:
konjugacija
transdukcija
elektroporacija
elektrošok
Kao selekcijski biljeg za stanice kvasca koristimo:
gen u biosintetskom putu histidina
gen za rezistenciju na ampicilin
gen u biosintetskom putu uracila
gen za B-galaktozidazu
gen za timidilat kinazu
Ključni proteini virusa influence su:
reverzna transkriptaza
Cre-rekombinaza
integraza
hemaglutinin
neuraminidaza
Virioni su:
virusni vektori za kloniranje
hibridni vektori
umjetni kromosomi
male kružne molekule DNA
virusne čestice
Dot-blot analiza uključuje:
detekciju proteina specifičnim protutijelom
razdvajanje proteina elektroforezom
prenošenje proteina s gela na membranu uz pomoće električnog polja
blokiranje veznih mjesta na membrani goveđim serumskim albuminom
razgradnju proteina specifičnim restrikcijskim endonukleazama
SYBR Green:
se koristi kod klasičnog multipleks PCR
je boja vezana na sondu u TaqMan metodi
fluorescira samo kada se veže za jl DNA
je prigušivač vezan na sondu u TaqMan metodi
Analiza DNA fragmenta polimorfizmom konformacije jl DNA:
provodi se u poliakrilamidnom gelu
provodi se u agaroznom gelu
provodi se u denaturirajućim uvjetima
provodi se u nedenaturirajućim uvjetima
kod heterozigota će dati 2 vrpce jer postoje 2 različita DNA fragmenta
Ako kod vektora s dva selekcijska biljega (tetR i ampR) gen kloniramo u restrikcijsko mjesto koje se nalazi unutar selekcijskog biljega tetR:
bakterije koje sadrže rekombinantni plazmid biti će otporne na oba antibiotika
na podlozi s oba antibiotika rastu bakterije koje sadrže prazan vektor
na podlozi bez antibiotika neće izrasti bakterije
uspješnost kloniranja možemo provjeriti insercijskom selekcijom
na podlozi s tetraciklinom rastu bakterije koje sadrže prazan vektor
Ako restrikcijska endonukleaza tipa II kida DNA unutar mjesta prepoznavanja izvan osi simetrije, mogu nastati:
ljepljivi krajevi
tupi krajevi
3' - istaknuti krajevi
5' - istaknuti krajevi
restrikcijska endonukleaza ne kida DNA izvan osi simetrije
Za sintezu cDNA koristi se:
RNA-ovisna DNA-polimeraza
RNA-polimeraza
RNAza
DNAza
Ekspresijske knjižnice:
su genomske knjižnice
su cDNA knjižnice
mogu se pretraživati protutijelima
mogu se pretraživati DNA-sondom
sadrže po jednu kopiju svakog gena u genomu
Koja od početnica može poslužiti za umnažanje jednolančanog nukleotidnog slijeda 5'-ATGCCTAGGTC-3'?
5'-ATGCC-3'
5'-TACGG-3'
5'-CTGGA-3'
5'-GACCT-3'
5'-GGCAT-3'
IPTG:
je induktor lac-operona
se veže na operator
je supstrat za B-galaktozidazu plave boje
nije supstrat za B-galaktozidazu
se ne koristi u ekspresijskom sustavu pET
O kvaščevom sustavu dvaju hibrida je točno:
gen za B-galaktozidazu je fuzioniran s kodirajućim slijedom transkripcijskog faktora GAL4 koji nosi uputu za domenu koja veže DNA
gen za B-galaktozidazu je fuzioniran s kodirajućim slijedom transkripcijskog faktora GAL4 koji nosi uputu za domenu koja aktivira transkripciju
gen za B-galaktozidazu se nalazi u genomu kvasca
gen za B-galaktozidazu se eksprimira jedino ako dolazi do interakcije između dvaju proteina
interakcija dvaju proteina detektira se kao proizvodnja plave boje u kolonijama kvasca
zaokruži točne tvrdnje:
topljivost rekombinantnog proteina možemo smanjiti ako snizimo temperaturu ekspresije, smanjimo količinu induktora i skratimo vrijeme ekspresije
topljivost rekombinantnog proteina možemo povećati fuzijom s pomoćnim proteinom
prinos rekombinantog proteina možemo povećati optimiranjem uporabe kodona
fuzija s pomoćnim proteinom ili afinitetnom oznakom omogućava detekciju rekombinantnog proteina
fuzija s pomoćnim proteinom ili afinitetnom oznakom omogućava lakše pročišćavanje rekombinantnog proteina
FLAG:
je pomoćni protein
je afinitetna oznaka
je komercijalno protutijelo na pomoćni protein
služi za pročišćavanje proteina afinitetnom kromatografijom na koloni s niklom
služi za detekciju rekombinantnog proteina
Bt-protein
uzrokuje otpornost na insekte
uzrokuje otpornost na herbicide
uzrokuje otpornost na biljne viruse
je bakterijski protein
je biljni protein
Prva transgenična životinja načinjena u laboratoriju:
je transgenični miš
je ovca Dolly
sadrži gen za hormon rasta kao transgen
izlučuje faktor IX u mlijeku
eksprimira transgen koji je kloniran pod kontrolom metalotioneinskog promotora
Ponavljanja jednostavnih slijedova su:
dugi raspršeni elementi, LINE
pokretni genetički elementi
dio centromere
retrovirusu slični elementi
satelitna DNA
UniProtKB:
je stukturna baza podataka
uključuje SwissProt i TrEMBL
je baza podataka bioloških slijedova
je klinička baza podataka
uključuje EMBL, GenBank i DDBJ
Onkogen abl nastaje
točkastom mutacijom
ampifikacijom
translokacijom
transpozicijom
insercijom
RNA-DNA kompleks naći ćemo u:
procesu popravka DNA izrezivanjem nukleotida
procesu produljivanja telomera
replikaciji
transkripciji
translaciji
U replikacijskim rašljama nećemo pronaći:
DNA-početnicu
DNA-polimerazu
helikazu
primazu
telomerazu
Zaokruži točne tvrdnje:
keajevi kromosoma su tupi krajevi (dvolančani) u stanicama s aktivnim telomerazama
primaza i polimeraza produljuju tromi lanac u telomernoj DNA
telomeraza djeluje kao reverzna transkriptaza
telomeraza produljuje 5'-kraj molekule DNA
telomerazu možemo izolirati iz bakterije
Transpozicija posredovana DNA-intermedijarima odvija se:
kod ugradnje bakteriofagne DNA u genom bakterije
mjesno-specifičnom rekombinacijom
uz reverznu transkripciju
Dvolančani lom ne popravlja se:
mjesno specifičnom rekombinacijom
fotoreaktivacijom
popravkom sklonom pogreškama
translezijskom sintezom DNA
Ako dođe do replikacije sekvence ATCGT nakon deaminacije citozina, a prije popravka deaminirane baze, nakon nekoliko generacija slijed nukleotida u stanicama kćerima će biti (prikazan je samo jedan lanac jednog od kromosoma):
u polovini stanica ATCGT, a u drugoj polovini ATUGT
u polovini stanica ATCGT, a u drugoj polovini ATTGT
u svim stanicama ATCGT
u svim stanicama ATTGT
u svim stanicama ATUGT
Lys i Arg:
većinom se nalaze u histonskom žlijebu
većinom se nalaze u N-terminalnom repu histona
u histonima se fosforiliraju
u histonima se metiliraju
uključeni su u stvaranje histonskog koda
Holoclar je:
terapeutsko monoklonsko protutijelo
terapeutski rekombinantni protein
genska terapija
terapija matičnim stanicama
vakcina
Slijed nukleotida 5'-GUAUGUGACUUCGAUCG-3' je nastao iz DNA koja ima nukleotidni slijed:
5'-CATACACTGAAGCTAGC-3' na nekodirajućem lancu
5'-CATACTGACTTGCTAGC-3' na kodirajućem lancu
5'-CGATCGAAGTCACATAC-3' na nekodirajućem lancu
5'-GCTAGCTTCAGTGTATG-3' na kodirajućem lancu
5'-GTATGTGACTTCGATCG-3' na kodirajućem lancu
Ukoliko obrišemo Pribnowljev slog ispred nekog gena za protein X u bakterijskom genomu:
doći će do povećane sinteze proteina X
doći će do povećane transkripcije gena za protein X
neće doći do sinteze proteina X
neće doći do transkripcije gena za protein X
Pribnowljev slog ne nalazimo u prokariotskim, nego u eukariotskim stanicama
Pojačivači genske ekspresije (engl. enhancer region):
mijenjaju strukturu kromatina
modificiraju strukturu baza (primjerice citozin prevode u metilcitozin)
moraju biti ispred mjesta početka transkripcije
su neophodni za ekspresiju gena
su proteini koji se vežu za DNA
Estrogenski receptor:
ima domenu za vezanje raloksifena
ima domenu za vezanje retinoične kiseline
ima domenu za vezanje RNA
mijenja histonski kod
nakon vezanja estrogena djeluje kao transkripcijski faktor
Metilacija CpG otoka u DNA:
je oštećenje koje se uspješno popravlja metil-transferazom
je simetrična na oba lanca
se nasljeđuje na stanice kćeri
štiti DNA od razgradnje virusnim restrikcijskim endonukleazama
zbog interferencije s polimerazama koči procese replikacije i transkripcije
Timidilat-kinaza:
u postupku stvaranja knock-out životinja ubija stanice kojima je gen inaktiviran homolognom rekombinacijom
u postupku stvaranja knock-out životinja ubija stanice kojima je gen inaktiviran nehomolognom rekombinacijom
je gen ubojica kod genske terapije raka
kao supstrat može koristiti ganciklovir
je fosfotransferaza
Kromatinski remodelirajući kompleksi:
dovode do promjena u konformaciji nukleosoma
energiju za remodeliranje dobivaju hidrolizom ATP-a
pomiču histonski oktamer duž DNA
remodeliraju histonski kod
uklanjaju i razgrađuju histonski oktamer s DNA
Što od navedenog NIJE glikoprotein?
alkalna fosfataza
eritropoetin
herceptin
imunoglobulin G
sve od navedenog su glikoproteini
N-vezani glikani:
imaju zajedničku oligosaharidnu preteču koja u potpunosti nastaje na dolikolu na citosolnoj strani ER
imaju zajedničku oligosaharidnu preteču koja u potpunosti nastaje na dolikolu u lumenu ER
krajnji oblik poprimaju u Golgijevom aparatu
prisutni su na Fc regiji protutijela
tvore glikozidnu vezu s proteinom između N-acetilglukozamina na reducirajućem kraju lanca (ugljik C1) i Asn unutar slijeda Asn-X-Thr/Cys
Kroz staničnu membranu difuzijom ne mogu proći:
hidrofobne molekule
male polarne molekule
velike polarne nenabijene molekule
molekule za koje postoje specifični proteinski transporteri ili kanali
steroidni hormoni
U endocitozi koja omogućuje selektivno uzimanje pojedinih molekula sudjeluju:
kalneksin
kalretikulin
klatrin
koneksin
receptor za molekulu koja se uzima
Koneksin je:
premosnica koja omogućuje izravnu komunikaciju između stanica
protein koji u kompleksu s proteinom adapterom sudjeluje u endocitozi posredovanoj receptorima
protein koji zajedno s kalretikulinom sudjeluje u pravilnom smatanju O-vezanih glikana
protein koji zajedno s kalretikulinom sudjeluje u pravilnom smatanju N-vezanih glikana
transmembranski protein
Steroidni hormoni mijenjaju gensku ekspresiju tako da:
se vežu na membranske receptore i aktiviraju signalne kaskade koje utječu na eskpresiju gena
se vežu izravno na DNA i potiču vezanje RNA-polimeraze
uzrokuju konformacijsku promjenu membranskih receptora
se interkaliraju između dušičnih baza i onemogućavaju vezanje transkripcijskih faktora
Parakrino djeluje:
CO2
inzulin
N2O
prostaglandin H2
tireoidni hormon
Natrijev azid (NaN3) je kemijski mutagen kojim možemo izazvati mutacije u sojevima bakterije Salmonella typhimurium koji ne mogu sintetizirati histidin. Djelovanjem NaN3:
mogu nastati mutacije koje onemogućavaju sintezu histidina
mutacije nastaju nasumično
mutacije nastaju na točno određenom ciljanom mjestu
mutacije nastaju isključivo u genomskoj DNA, ali ne i na plazmidu s genom muc
sve nastale mutacije daju fenotip koji je moguće razlikovati od fenotipa ishodnog soja
G-protein:
kao fiziološki "prekidač" prekida djelovanje hormona
prilikom aktivacije otpušta GDP i veže GTP
prilikom deaktivacije otpušta GTP i veže GDP
sastoji se od dvije podjedinice: alfa i gamabeta
alfa podjedinica nakon aktivacije radi kao gvanil-ciklaza
Receptorske protein-tirozin-kinaze:
međusobno imaju vrlo homologne N-krajeve
povezane su kovalentnim vezama s unutarstaničnim protein-tirozin-kinazama
prenose signale do unutrašnjih ciljeva posredstvom proteina
se nakon vezanja liganada autofosforiliraju čime se povećava aktivnost protein-kinaze
se nakon vezanja liganada dimeriziraju
U regulaciji metabolizma glikogena, aktivacijom protein-kinaze A dolazi do:
aktivacije fosforilaza-kinaze fosforilacijom
aktivacije glikogen sintaze fosforilacijom
inaktivacije glikogen fosforilaze fosforilacijom
katalitička podjedinica prelazi u jezgru i fosforilacijom CREB-a posreduje regulaciju genske ekspresije
odvajanja regulatornih od katalitičkih podjedinica, nakon čega enzimski aktivne regulatorne podjedinice kataliziraju fosforilaciju serinskih ostataka na ciljnim enzimima
Mutacija u internalizacijskom signalu receptora za LDL dovodi do:
efektivnije endocitoze posredovane receptorima
obiteljske hiperkolesterolemije
povišene koncentracije kolesterola u jetri
smanjene interakcije između kompleksa klatrin-protein adapter i receptora za LDL
Signalni put JAK/STAT:
obuhvaća dimerizaciju citokinskih receptora koji putuju u jezgru i reguliraju gensku ekspresiju
uključuje fosforilaciju i dimerizaciju STAT proteina, te putovanje STAT-STAT dimera u jezgru gdje utječe na gensku ekspresiju
uključuje JAK-kinazu koja fosforilira serinske ostatke na STAT proteinu
uključuje JAK-kinazu koja fosforilira serinske ostatke na JAK proteinu
započinje vezanjem citokina
Što je netočno?
p53 je često mutiran u ljudskim tumorima
p53 djeluje kao transkripcijski faktor
p53 je kinaza koja fosforilira ATM i Chk2
p53 regulira ekspresiju gena koji zaustavljaju stanični ciklus
povećanjem oštećenja DNA povećava se koncentracija p53 u stanici
Mehanizam MCM-ORC-MCM kompleksa koji je odgovoran za replikaciju cjelokupne DNA samo jednom, obuhvaća:
kontinuirano vezane ORC proteine na DNA
uklanjanje MCM proteina odmah nakon inicijacije replikacije DNA
vezanje MCM proteina na DNA za vrijeme G2 faze
vezanje ORC proteina na DNA nedugo nakon početka replikacije
vezanje ORC proteina na početku G1 faze
Zaokruži točne odgovore vezane uz stanični ciklus životinjske stanice
Cdc2/ciklin A kompleks omogućava formiranje diobenog vretena i raspad jezgrine ovojnice
Cdc2/ciklin B kompleks omogućava kondenzaciju kromatina
Cdc2/ciklin E kompleks omogućava fragmentaciju Golgijevog aparata i ER
regulacija prolaska kroz restrikcijsku točku G1 temelji se na stvaranju kompleksa CDK4/ciklin D
regulacija prolaska kroz restrikcijsku točku S temelji se na stvaranju kompleksa CDK6/ciklin D
Kondenzine u kromosomima G2 faze nalazimo:
duž cijele duljine kromosoma
kondenzine ne nalazimo za vrijeme G2 faze
samo u području centromera
u svim dijelovima kromosoma osim u telomerama
u svim dijelovima kromosoma osim u centromerama
Homologna rekombinacija mejoze događa se za vrijeme:
anafaze I
anafaze II
metafaze I
profaze II
U slučaju izostanka oplodnje, jajna stanica propada u kojoj fazi mejoze?
anafazi II
metafazi II
profazi II
telofazi II
Intrizički put apoptoze:
povezan je s oštećenjem DNA
aktivira se u prisutnosti faktora rasta
uključuje kaspazu-8
potaknut je vezanjem faktora tumorske nekroze na TNF-receptor
povezan je s otpuštanjem citokroma C iz MTH
Fagocitoza apoptoznih stanica je moguća jer:
dolazi do prelaska fosfatidil-serina s unutrašnje strane membrane apoptozne stanice na vanjsku
dolazi do prelaska fosfatidil-serina s vanjske strane membrane apoptozne stanice na unutrašnju
klasa I MHC receptora prezentira fagocitu antigene koji upućuju na apoptozu
mehanizam fagocitoze apoptoznih stanica nije poznat
u organizmu postoje specifična protutijela na apoptozne stanice
Nastanak raka kod čovjeka vezanjem i inaktivacijom tumor supresorskih gena Rb i p53 uzrokuju:
retrovirusi
humani papiloma virusi
bakteriofagi
prioni
adenovirusi
Plastično posuđe za uzgoj staničnih kultura sterilizira se:
autoklaviranjem
suhom sterilizacijom
brisanjem 70%-tnim etanolom uz plamen
gama zračenjem
UV-zračenjem
Ako gen za protein Bax fuzioniramo s genom za zeleni fluorescentni protein, fuzijski protein ćemo bioluminescencijom detektirati u:
citoplazmatskoj membrani
citoplazmi
jezgrinoj membrani
ER
mitohondrijskoj membrani
Citoplast nastaje:
djelovanjem enzima zimoliaze na stanicu kvasca
djelovanjem kalcijevog klorida na stanice E.coli
enukleacijom neoplođene jajne stanice
prijenosom jezgre somatske stanice u jajnu stanicu bez jezgre
uklanjanjem stanične stijenke biljne stanice
Afinitetnom kromatografijom na koloni s niklom moguće je učinkovito pročistiti rekombinantni protein čiji je gen povezan s:
afinitetnom oznakom FLAG
afinitetnom oznakom His-Tag
genom za pomoćni protein glutation-S-transferazu
reporterskim genom za zeleni fluorescentni protein
reporterskim genom za B-galaktozidazu
O regulaciji lac-operona točno je slijedeće:
CAP (catabolyte activator protein) u kompleksu s cAMP sprječava inicijaciju transkripcije lac-operona
ekspresija I-gena (lac-represor) pod kontrolom je lac-operatora
ispred svakog gena za razgradnju laktoze nalazi se regulatorna regija lac-operona
lac-represor je slijed nukleotida u DNA na koji se veže laktoza i tako aktivira lac-operon
vezanje laktoze mijenja konformaciju lac-represora i tako aktivira lac-operon
Strimvelis
je in vivo genska terapija za X-SCID
je ex vivo genska terapija za ADA-SCID
uključuje prijenos gole DNA
uključuje prijenos terapeutskog gena putem retrovirusa
je prva odobrena genska terapija u Europi
Apoptosom:
aktivira inicijatorku kaspazu-9
je dimer proteina Apaf-1 i citokroma c
je kompleks izgrađen od proteina Apaf-1 i Bcl-2
razgrađuje DNA tijekom apoptoze
se nalazi u mitohondriju
Herceptin:
je monoklonsko protutijelo koje prepoznaje receptor za epidermalni faktor rasta
smanjuje rak dojke za 20-30% kod pacijenata koji odgovaraju na terapiju
je prirodno protutijelo prisutno kod 20-30% pacijenata s rakom dojke
je učinkovit kod svih pacijenata s rakom dojke, no zbog visoke cijene daje se samo u 20-30% slučajeva
je monoklonsko protutijelo koje prepoznaje faktor rasta mastocita
Alotipovi imunoglobulina G su:
proizvodi različitih klonova B-limfocita u istom organizmu
rezultat različitog preslagivanja imunoglobulinskih gena
različita protutijela koja prepoznaju isti antigen
proizvodi različitih genetičkih lokusa za imunoglobulinske gene
Soj Salmonella typhimurium TA98:
ne raste na podlozi s ampicilinom
je bakterijski soj mutator
daje 75-200 spontanih revertanata u kontrolnom pokusu
je prototrof za histidin
koristi se za dokazivanje potencijalne karcinogenosti neke tvari
Sekundarno protutijelo:
najčešće je monoklonsko protutijelo
prepoznaje jedan ili više epitopa na primarnom protutijelu
proizvodi se u kulturi hibridoma stanica
povećava specifičnost imunokemijske metode
koristi se isključivo u metodi ELISA
je u odsutnosti hormona vezan na DNA
je u odsutnosti hormona vezan s histon-deacetilazom
se dimerizira vezanjem estrogena
kao monomer se spaja s histon-acetil-transferazom
vezanjem estrogena difundira iz citoplazme u jezgru
Koji se krajevi fragmenata nastalih djelovanjem restrikcijskih endonukleaza mogu povezati DNA-ligazom?
5' - istaknuti i tupi
tupi i tupi
tupi i 3' - istaknuti
5' - istaknuti i 3' - istaknuti
Ekdison je:
translacijski faktor
steroidni hormon
unutarstanični enzim
površinski receptor
inhibitor MAP kinaza
Ugradnju terapeutske DNA na specifično mjesto unutar kromosoma 19 kod genske terapije omogućuju:
adeno-pridruženi virusi
lentivirusi
herpes simplex virusi
Ct (cycle treshold) pri real time PCR-u najbolje možemo definirati kao:
broj ciklusa nakon kojeg umnažanje nekog fragmenta ulazi u plato fazu
broj ciklusa nakon kojeg određeni fragment DNA dostiže zadanu razinu fluorescencije
razliku u broju ciklusa nakon kojeg završava umnažanje različitih fragmenata DNA
ciklus u kojem dolazi do vezanja TaqMan sonde na PCR produkt
broj ciklusa nakon kojeg određeni fragment DNA prelazi prag detekcije instrumenta
Multipleks PCR analiza:
istovremeno analizira ekspresiju više gena izravno iz staničnog ekstrakta
temelji se na više parova početnica koje omogućavaju umnažanje više ciljnih fragmenata
koristi više od dvije početnice za umnažanje svakog fragmenta DNA
omogućava pouzdanu kvantifikaciju zbog eliminiranja problema plato-faze
Umnažanje fragmenta DNA lančanom reakcijom Taq-polimeraze nikada NEĆE uspjeti ako:
u reakcijskoj smjesi nisu sva četiri deoksinukleotida
početnice imaju različit broj nukleotida
je razmak između 3' kraja jedne početnice i veznog mjesta za drugu početnicu više od 0,3 kb
se vezanje početnica (annealing) provodi na više od 45 C
je kalup za umnažanje ukupna genomska DNA
Koji od navedenih procesa uključuje mjesno-specifičnu rekombinaciju?
somatska mutageneza imunoglobulinskih gena
ugradnja fragmenata u umjetne kromosome
popracak pirimidinskih dimera nastali pod utjecajem UV-zračenja
popravak DNA sklon pogreškama
ugradnja bakteriofaga lambda u genom E. coli
UniProt:
sadrži podatke dobivene kristalografijom X-zraka i metodom NMR
obuhvaća SwissProt, TrEMBL i PIR
je integrirana baza podataka
je strukturna baza podataka
je dio genomskog preglednika Ensembl
Merispace je:
rekombinantna želučana lipaza sisavaca proizvedena u biljnim stanicama
rekombinantno protutijelo naspram bakterije Streptococcus mutans proizvedeno u biljnim stanicama
jestiva vakcina protiv S. mutans proizvedena u duhanu
herbicid na koji su otporni usjevi s modificiranom EPSP sintazom
genetički modificirana riža s povećanim sadržajem B-karotena
Koja od metoda nam omogućava da utvrdimo veže li se transkripcijski faktor na određeni fragment DNA?
kvaščev sustav dvaju hibrida
SSCP
PCR
sekvenciranje Sangerovom di-deoksi metodom
metoda pomaka u gelu
Kod elektrofuzije dviju stanica za prijenos velikih fragmenata DNA koristi se:
P1 umjetni kromosom
kozmid
PAC
YAC
BAC
aktivira inicijatorsku kaspazu-3
se nalazi u citoplazmi
Što od navedenog nije biljni hormon?
auksin
etilen
opin
citokinin
giberelin
Stanice raka prodiru kroz bazalnu membranu i šire se u okolno tkivo:
izlučivanjem faktora rasta
izbjegavanjem apoptoze
gubitkom kontaktne inhibicije
zbog mutacije u genu p53
izlučivanjem proteaza
Na tumor-supresorske proteine p53 i Rb ne vežu se proteini
adenovirusa
papilomavirusa
herpes virusa
retrovirusa
virusa SV40
Integrini sudjeluju u stvaranju:
tijesnih spojeva
čvrstih spojeva
hemidezmosoma
sinaptičkih vezikula
ABC transportera
Produkt djelovanja alkalne fosfataze kod imunokemijskih metoda:
je p-nitrofenilfosfat
u metodi ELISA detektira se kolorimetrijski
nastaje reakcijom u kiselom mediju
je uvijek topljiv u vodi
intenzitetom je izravno proporcionalan koncentraciji antigena u detekciji metodom Dot-blot
CAP (catabolyte activator protein) utječe na lac operon tako:
da onemogućava vezanje lac represora na operator
da pojačava vezanje lac induktora na operator
da u kompleksu s cAMP višestruko povećava inicijaciju transkripcije
da se veže na DNA u promotorskoj regiji i potiče vezanje RNAp
Steroidni hormoni:
se vežu na jezgrine receptore
aktiviraju kaskadu vezanu uz G protein
aktiviraju receptore na staničnoj membrani
izravno reguliraju sintezu proteina
izravno reguliraju gensku ekspresiju
U većini slučajeva protein kinaze:
hidroliziraju proteine
dodaju fosfatnu skupinu na proteine
uklanjaju fosfatnu skupinu s proteina
stimuliraju adenilat ciklazu
vežu cGMP
Gola virusna čestica:
nema membransku ovojnicu
ubacuje genetički materijal u stanicu domaćina izravnom penetracijom
ne sadrži kapsomere
ne može se vezati na površinu stanice domaćina
je drugim riječima nukleokapsida
Koji od navedenih gena nisu onkogeni?
c-myc
SV40
ras
p53
Rb
O genskim knjižnicama je točno:
želimo li načiniti genomsku knjižnicu svejedno je koristimo li DNA izoliranu iz jetre ili iz gušterače
genomska knjižnica pretražuje se Western blotom
ekspresijska knjižnica je cDNA knjižnica
učestalost pojedinačnih gena jednaka je u genomskoj i cDNA knjižnici
cDNA knjižnica ne sadrži fragmente koji se preklapaju
Prva bioinformatička baza podataka:
nastala je zalaganjem Margaret Dayhoff
bila je baza nukleotidnih slijedova
bila je baza podataka 3D struktura
bila je literaturna baza podataka
bila je baza aminokiselinskih slijedova
Molekulu cDNA sintetizira:
DNA-ovisna DNA-polimeraza
Taq-polimeraza
O genima izvjestiteljima je točno:
omogućuju praćenje ekspresije gena u pojedinim tipovima stanica
koriste se kao selektivni biljezi
omogućuju praćenje lokalizacije proteina u stanici
koriste se u kvaščevom sustavu dvaju hibrida
koriste se u delecijskoj analizi kontrolnih genskih regija
Ako kloniramo gen u vektor koji ima mogućnost plavo-bijele selekcije, kolonije koje sadrže prazni plazmid uzgajane na podlozi uz IPTG i X-Gal:
imat će funkcionalnu B-galaktozidazu
imat će inaktiviranu B-galaktozidazu
bit će plave boje
bit će bijele boje
O kaspazama je NETOČNO:
aktiviraju se putem IAP i Bcl-2
N-glikolizacija počinje u Golgijevom aparatu
O-glikolizacija počinje u ER
N-vezani šećeri se dodaju na Asn
za odvijanje apoptoze potrebna je energija
stanice imunosnog sustava nikada ne umiru apoptozom
Koje su od navedenih molekula povezane s Ca2+ u prijenosu signala?
Ca2+ crpke
inozitol-1,4,5-trifosfat
receptorske gvanil-ciklaze
kalmodulin
G-proteini
O kalneksinu je netočno:
jedan je od proteina iz porodice ciklina koji reguliraju stanični ciklus
zajedno s protein-kinazom Cdc2 tvori faktor poticanja sazrijevanja (MPF)
produkt je tumor-supresorskog gena bcl2
receptor je za manozu-6-fosfat
lektin je uključen u kontrolu smatanja glikoproteina
Test trudnoće:
uključuje elektroforezu i PCR
primjenjuje se za kvantifikaciju nukleinskih kiselina
primjenjuje se za detekciju proteina
temelji se na svojstvu protutijela da specifično prepoznaje antigen
je imunokemijska metoda
Stanice E.coli divljeg tipa:
ne mogu sintetizirati sve AK
mogu rasti u bogatom mediju
mogu rasti u minimalnom mediju
rastu brže od animalnih stanica u kulturi
DNA se pod utjecajem električnog polja kreće prema anodi
razmaz DNA posljedica je slabijeg razlučivanja agaroznog gela
u električnom polju manji fragmenti DNA putuju brže od velikih
elektroforeza u agaroznom gelu je vodoravna elektroforeza
etidijev bromid fluoresceira nakon osvjetljavanja UV-svjetlom isključivo kada se interkalira u molekulu DNA
O automatskom sekvenciranju DNA Sangerovom dideoksi metodom je točno:
za sintezu DNA koriste se fluorescentno obilježeni dideoksinukleotidi
sinteza DNA se odvija u smjeru 5'->3'
fragmenti nastali u reakciji sekvenciranja razdvajaju se kapilarnom elektroforezom
omogućava lako sekvenciranje velikih molekula DNA
omogućava sekvenciranje isključivo jednolančane molekule DNA
O ugradnji transgena u genom je točno:
integracija je najčešće nasumična i predstavlja rijedak događaj
transgen se uvijek integrira u jednoj kopiji
kimere nastaju ugradnjom transgena u embrionalne matične stanice
knock-out označava inaktivaciju gena u genomu
homologna rekombinacija čini <2% svih integracijskih događaja
U Amesovom testu soj bakterije S. typhymurium uzgaja se na podlozi s ampicilinom jer:
soj S. typhymurium ne može rasti u odsutnosti ampicilina
soj S. typhymurium sadrži plazmid koji povećava osjetljivost na mutacije, a ima i selektivni biljeg za ampicilin
ampicilin sudjeluje u sintezi histidina
ampicilin povećava osjetljivost na mutacije
ampicilin sprječava rast plijesni
O staničnim kulturama je točno:
konfluentnost je mjera gustoće stanične kulture
za rast trebaju vitamine i faktore rasta
mogu rasti u jednostavnom minimalnom mediju kao i bakterije
rastu sporije od bakterijskih stanica
rastu brže od kvasaca i gljivica
Što od navedenog nije kodirajući slijed?
gen koji se prepisuje u mRNA
gen koji se prepisuje u tRNA
gen koji se prepisuje u snRNA
dorađeni pseudogen
porodica gena
Operon:
je karakterističan za eukariotske genome
sadrži više od jednog gena
sadrži više od jednog promotora
gotovo nema intergenskih regija
je isto što i operator
Koje su tvrdnje o ponavljajućoj DNA točne?
centroere i telomere sadrže ponavljajuću DNA
ponavljajući sljedovi mogu se identificirati praćenjem reasocijacije DNA
ponavljanja jednostavnih sljedova nazivamo i satelitnom DNA
ponavljajuća DNA čini veliki udio u ukupnoj DNA sisavaca
pokretne genetičke elemente ne ubrajamo u ponavljajuću DNA
Molekulu DNA radioaktivno obilježavamo uporabom
DNAp I
alkalne fosfataze
polinukleotid-kinaze
reverzne transkriptaze
RNA-ovisne DNAp
Postupak Northern blot analize uključuje:
razdvajanje molekula DNA elektroforezom u poliakrilamidnom gelu
prijenos RNA na membranu
fiksiranje molekula na membranu povišenom temperaturom
Da bi retrovirus mogao poslužiti kao vektor za gensku terapiju potrebno je:
ukloniti većinu virusnih proteina
spriječiti izazivanje imunosnog odgovora
spriječiti pakiranje virusnih čestica unutar organizma
omogućiti propagaciju virusa unutar organizma
svi su odgovori točni
Ukupna duljina molekula DNA u neoplođenoj jajnoj stanici čovjeka:
je nešto manja od promjera jezgre
je manja no u ostalim stanicama u tijelu
je oko 1 mikrometar
je oko 1 metar
je oko 100m
Velike prinose rekombinantnih proteina omogućuju:
bakulovirusni vektori
ekspresija u kulturi stanica sisavaca
ekspresija u kvascu Pichia pastoris
pET sustav u bakterija
Kozmid je:
hibridni vektor
kvaščev vektor
bakteriofag
vektor koji sadrži cos mjesto
vektor koji sadrži ishodište replikacije iz bakteriofaga
O faktoru poticanja sazrijevanja (MPF) je netočno:
je dimer ciklina B i protein kinaze Cdc2
ubrizgan u citoplazmu može potaknuti ulazak oocite u mitozu
djeluje kao kontrolna točka na prelasku iz G1 u G2 fazu
aktivan je samo u G1 fazi
omogućuje uspostavljanje kompleksa ishodišta replikacije
O genskim knjižnicama je netočno:
želimo li načiniti genomsku knjižnicu svejedno je koristimo li DNA izoliranu iz jetre ili gušterače
učestalost pojedinačnih gena jednaka je u genomskoj i ekspresijskoj knjižnici
genomska knjižnica ne sadrži fragmente koji se preklapaju
Uz pretpostavku da započinjete s izoliranom genomskom DNA, za izradu genske knjižnice potrebno je:
vektor za kloniranje
restrikcijska endonukleaza
ligaza
DNA polimeraza
Recirkularizacija plazmida sprječava se:
propagacijom u soju E.coli koji sadrži Dam metilazu
uporabom alkalne fosfataze
uporabom dvije različite restrikcijske endonukleaze
kreiranjem tupih krajeva
dodatkom glicerola u reakcijsku smjesu
O ugradnji transgena u genom je netočno:
kimere nastaju ugradnjom transgena u EMS
knock-out označava inaktivaciju gena uglavnom unošenjem strane DNA
Interakcije dvaju proteina istražujemo:
metodom pomaka u gelu
metodom kvaščevog sustava dvaju hibrida
metodom zaštite DNAzom
delecijskom analizom kontrolnih genskih regija
niti jedan odgovor nije točan
Izokaudameri su restrikcijske endonukleaze koje:
prepoznaju različite slijedove, a kreiraju identične krajeve
kreiraju isključivo 5' krajeve
kreiraju isključivo 3' krajeve
prepoznaju iste slijedove, a kreiraju različite krajeve
Protein s novim svojstvima možemo dobiti:
ciljanom mutagenezom
serijskim kloniranjem
nasumičnom mutagenezom
Metodom rekombinantne DNA transgeničnim se može učiniti:
E. coli
kvasac
biljka duhana
miš
sve navedeno
BIoinformatičke metode omogućuju:
mapiranje eksperimentalno dobivenih nukleotidnih slijedova
modeliranje 3D struktura
evolucijsko uspoređivanje slijedova
predviđanje osobina proteina
O genima izvjestiteljima je netočno:
omogućuju praćenje genske ekspresije u pojedinim tipovima stanica
Protoplast:
je isto što i citoplast
je stanica bez membrane
je stanica bez jezgre
nastaje enzimskom razgradnjom stanične stijenke
nastaje enukleacijom
O ekspresijskim vektorima je netočno:
translacijski vektori sadrže vezno mjesto za ribosom
transkripcijski vektori služe za dobivanje RNA polimeraze
ekspresijski vektori sadrže regulatorne slijedove za transkripciju
vektor pET sadrži gen za RNA polimerazu bakteriofaga T7
ekspresijski vektori često su shuttle vektori
Multipleks PCR se razlikuje od običnog jer:
koristi multipleks reverznu traskriptazu
analizira DNA izoliranu iz više izvora
sadrži više parova početnica
ne zahtijeva naknadnu analizu PCR produkata
može pouzdano kvantificirati količinu kalupa
Unos DNA putem virusa koristi se za:
transformaciju kvasca
transfekciju bakterija
transdukciju bakterija
Uni-prot je:
Geni izvjestitelji:
omogućuju praćenje ekspresije proteina u stanici
se koriste u istraživanju interakcija protein - protein
se koriste kod delecijske analize promotora
se koriste u istraživanju interakcija protein - DNA
se koriste kao selektivni biljezi
Prednost metode polimorfizma jednolančane DNA pred Southern blotom je:
SSCP može detektirati sve mutacije, a Southern blot samo jednu traženu
nema prednosti
da analizira dvolančanu DNA
je jeftinija metoda
ništa nije točno
Dideoksi nukleotidi:
nemaju OH skupina na 2' i 3'
nemaju OH skupina na 3' i 4'
mogu se obilježiti fluorescentnom bojom
koriste se u Sangerovoj metodi
koriste se u Southern blotu
Što od slijedećeg ne sadrži proteine?
virion
prion
sve navedeno sadrži proteine
Kod litičkog faga u konačnici dolazi do:
lize stanice
otpuštanja novih virusnih čestica
integracije genoma virusa u domaćinski genom
nastanka profaga
Koji od ovih virusa ne može uzrokovati tumore?
virus bjesnoće
papiloma virusi
virus gripe
Restrikcijske endonukleaze tipa 2:
kidaju izvan mjesta prepoznavanja
kidaju uzvodno od mjesta prepoznavanja
kreiraju tupe krajeve
kidaju unutar mjesta prepoznavanja koje je palindrom
kidaju nizvodno od mjesta prepoznavanja
Ako smo ugradili neki gen u vektor s lac operonom i uzgajali tu bakteriju (koja ima mogućnost plavo-bijele selekcije) s takvim vektorom na podlozi s X-Gal i IPTGom:
kolonije će biti plave
kolonije će biti bijele
imat ćemo nefunkcionalnu galaktozidazu
imat ćemo funkcionalnu galaktozidazu
bakterije neće rasti na takvoj podlozi
Ponavljajući slijedovi DNA:
čine mali dio DNA
kodiraju za proteine
uključuju satelitnu DNA
mogu se pratiti kinetikom reasocijacije
sadrže ih centromere i telomere
Radioaktivnim timidinom se mogu obilježiti samo stanice koje su:
u S fazi
u G1 fazi
u G2 fazi
u M fazi
u citokinezi
Modifikacija adenovirusa za gensku terapiju uključuje:
uklanjanje većine virusnih proteina
redukcija imunogenosti
sprječavanje pakiranja virusnih čestica unutar organizma
omogućavanje umnažanja virusa unutar organizma
omogućavanje rekombinacije sa srodnim virusima u organizmu
dva ishodišta replikacije
PAC sadrži sve navedeno
Biološke baze podataka:
su baze slijedova DNA
su baze slijedova proteina
su baze 3D struktura
povezane su i dostupne na internetu
Kaspaze:
sudjeluju u apoptozi
aktiviraju ih proteini iz porodica IAP i Bcl
sintetiziraju se inaktivne preteče
pripadaju porodici serinskih proteaza
kidaju iza Thr
Dušikov oksid:
prolazi kroz membrane difuzijom
prolazi kroz membrane aktivnim transportom
djeluje endokrino
djeluje parakrino
ništa od navednog nije točno
MPF:
se defosforilira tijekom profaze
ciklin B se razgrađuje u metafazi mitoze
defosforilira se Cdc2
se defosforilira tijekom metafaze
je kompleks Cdc2 i ciklina D
Svojstva stanica raka uključuju:
smanjenu adhezivnost
izlučivanje proteaza
poremećaje diferencijacije
izbjegavanje apoptoze
CAP potiče transkripciju tako da:
potiče vezanje induktora za represor
sprječava vezanje represora na DNA
se veže za promotor i potiče vezanje RNA polimeraze
stupa u interakciju s cAMP i višestruko povećava transkripciju
asparaginske su proteaze
cijepaju peptidnu vezu iza Glu
aktivira ih IAP
Nekodirajući slijed čini:
gen za tRNA
gen za mRNA
pseudogeni
gen za snRNA
sve od navedenog je točno
Northern blot uključuje:
fiksiranje RNA na membranu temperaturom
kidanje genoma s RE
elektroforezu DNA
DNA mikročip tehnologija:
daje kvantifikaciju podataka
nakon nje je potrebna PCR analiza
analizira DNA ili RNA
veže boju na DNA
otkriva više ekspresijskih gena
