A veces el mismo Rousseau, que conoce profundamente la psicología humana y la de su alumno, y que intentará
que surjan libremente del fondo de su alma los buenos criterios morales no corrompidos aún por la sociedad.
Negativa, porque ha de hacerse lejos del influjo corruptor de la sociedad, en plena naturaleza. Esta atención
individualizada al niño trae como consecuencia un principio pedagógico nuevo para todas las pedagogías tradicionales:
el niño no es un adulto en miniatura, sino un ser humano que pasa por sus propias y peculiares fases de desarrollo.
La educación natural que se da al niño ha de consistir, en suma, en evitar todo lo que, en la sociedad, tienda a influir
sobre la personalidad propia del niño. El gusto (el juicio) moral surgirá de la sensibilidad debidamente educada,
igual como de la conciencia surgirá la razón. El objetivo de la educación es formar primero al hombre, luego al cabeza
de familia y luego al ciudadano. El Emilio ha sido paradigma de corrientes pedagógicas posteriores,
denominadas «no directivas».Este método natural de educación ni impone ni impide la religión. Por eso, el libro
IV de Emilio presenta la Profesión de fe de un vicario saboyano, donde Rousseau expone sus ideas sobre la
religión natural, su deísmo, que cae lejos del materialismo y ateísmo de algunos ilustrados: la verdadera religión surge
del interior de cada uno, no de las imposiciones de las iglesias, y es más cosa del corazón que de la inteligencia:
«Hijo mío, mantén siempre en tu alma el deseo de que exista Dios y nunca dudarás de ello». Esta religión interior
es la del hombre; está, además, la religión del ciudadano, que es la que establece el poder civil y determina el
soberano: fundamentalmente es la misma que la interior, con el añadido de la obligación de observar el contrato
social y las leyes, y la imposición de la tolerancia. Las religiones establecidas, como el cristianismo, son
perniciosas para la sociedad.
Rousseau busca que surjan libremente del alma de los alumnos los buenos criterios morales no corrompidos aún
por la sociedad, entonces dentro de la realidad colombiana:
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