![]() |
Created by stina.k.paulsson
almost 10 years ago
|
|
Question | Answer |
Vilka tre huvudtyper av RNA finns? Funktionen i korta drag? | rRNA - del av ribosomen tRNA - Bär aminosyror till ribosomen mRNA - Avkodas till protein (störst andel) |
Vad är den genetiska koden? | Den genetiska koden beskriver hur en sekvens av nukleotid-baser i en DNA-molekyl eller RNA-molekyl skall översättas till en sekvens av aminosyror i ett protein. |
Hur många olika kodoner finns det? Vilka används som stopkodon och vilken används som startkodon? | 64 st. UAA, UAG UGA används som stopkodon och AUG (metionin) används som startkodon. |
Det är kodonets läsram som bestämmer vilken aminosyra som kodas. Men hur bestäms läsramen? | Läsramen bestäms utifrån var man startar translationen av mRNA - vid det första AUG startar translationen och vid det första stoppkodonet slutar translationen. |
Beskriv tRNA (struktur) och deras funktion. | Har en treklöver-struktur innehållande flera modifierade nukleotider och regioner med dubbeltrådiga sekvenser. Har ett antikodon som ska vara komplementär till kodonet. Aminosyra-bindning till -OH är i 3' änden av tRNA:t. |
Vad är aminoacyl-tRNA-syntetaser? Vad kräver reaktionen med syntaserna? | Kopplingen tRNA med en aminosyra katalyseras av aminoacyl-tRNA-sytetaser. Vid varje syntes åtgår en ATP (2 fosfat hydrolyseras) |
Beskriv "Proofreading mekanismen" för aminoacylering. | Det är viktigt att tRNA har rätt aminosyra till de antikodon som finns på tRNA:t för att translationen ska bli rätt. aminoacyl-tRNA-sytaserna (de som katalyserar kopplingen mellan aminosyran och tRNA) har två active site, syntes-site och editerings-site. Den rätta aminosyran har bra passform i syntes-siten men dålig i editing-siten. Alla aminosyror förutom den rätta kommer att kunna pressas in i editing-siten - den som inte passar får "åka vidare" till syntes-siten. |
Hur känner aminoacyl-tRNA-syntetaset igen rätt tRNA? | Väldigt olika beroende på aminosyran i antikodonet men generellt sätt kan man säga att den detekterar unika nukleotider. Dessa unika nukleotider kan ibland vara själva antikodonet, ibland antikodonet + en till nukleotid eller ibland har antikodonet ingen påverkan alls. |
Det finns 61 st kodoner för 20 aminosyror men bara upp till ca 50 olika antikodoner - Hur är det möjligt att få ett antikodon till varje kodon? | Genom wobbling - De två första nukleotiderna i tRNA är har stark basparning men den sista kan vara lite mer flexibel och har ofta en svag basparning - Detta gör det möjligt att läsa fler kodoner för samma aminosyra. |
Hur och var bildas rRNA till ribosomens lilla och stora subenhet? | I nukleolen transkriberar RNA-polymeras i rDNA-repetitioner (icke protein kodande DNA) och en RNA-precursor bildas. RNA-precursorn klyvs till mogna rRNA i olika storlekar som sedan kan binda till ribosomproteiner och lilla och stora ribosom subenheten skapas. |
Var i ribosomen finns bindningsstället för mRNA och tRNA? Vad kallas bindningsställena för tRNA? | Den bindande siten för mRNA finns i den lilla subenheten. "På" denna site finns tre bindningsställen för tRNA - A-site, P-site och E-site. |
Vilken funktion har RNA:t respektive proteinerna i ribosomerna? | RNA:t fungerar som ett riboenzym - katalyserar RNA:t i ribosomen. Proteinerna i ribosomerna skyddar och stabiliserar RNA:t. |
Förklara elongeringen i 3 steg. | 1. Aminoacyl-tRNA binder m.h.a. EF-TU+GTP till en exponerad kodontriplett i A-site via basparning. Använd tRNA lämnar E-site. 2. Katalys av peptidyl-överföring mellan peptid-tRNA i P-site och aminoacyl-tRNA i A-site. Spjälkning av peptid-tRNA-bindning i P-site. Katalysen medieras av rRNA i ribosomen 3. Translokeringar - Först storasubenheten och därefter lilla subenheten av ribosomen. Peptid-tRNA i A-site hamnar i P-site. Detta kräver eEF2/GTP. Sedan återupprepas elongeringscykeln |
Vilka två sätt för att initiera translationen?Hur stor är andelen av varje sätt? | - CAP-beroende - 9 av 10 -CAP-oberoende - 1 av 10 |
Hur fungerar den CAP-beroende initieringen av translation? Hur regleras initieringsfaktorerna? | Initieringsfaktorerna + initiator-tRNA (metionin) och den lilla ribosomsubenheten binder till CAP-strukturen på mRNA. mRNA skannas till första AUG och när den hittas dissocierar initieringsfaktorerna som sitter fast i den lilla subenheten. Den stora ribosomsubenheten binder och elongeringen kan starta. Initieringsfaktorerna regleras genom fosforylering. |
Hur fungerar CAP-oberoende translation? | En CAP-struktur behövs ej men finns ofta ändå. En CAP-oberoende initiering behöver inte starta translationen på första AUG utan preinitieringskomplexet känner igen en sekundärstruktur på mRNA, IRES. Initieringen startar på det första AUG som kommer efter IRES. |
Hur fungerar termineringen? När avslutas translationen? | Translationen avslutas av ett stopkodon (UAA, UAG, UGA) som binder release-faktorer. Bindningen av release-faktorer ger en konformationsförändring i peptidyltransferaset och vatten adderas till COO- i P-sitet. Peptid, ribosomsubenheter, tRNA och mRNA dissocierar |
Var sker proteinsyntesen? Vad är en polysom? | Proteinsyntesen sker på ER-bunda och fria ribosomer. Polysomer = många ribosomer på en mRNA |
Vad är Pol-A-förkortning? När används det? | Poly-A-förkortning är en timer som räknar ner livstiden hos mRNA. Under translationen så binder initieringsfaktorerna till både cappen och polyadenyleringen (AAAA). När translationen är klar/när ett mRNA inte behövs längre så släpper initieringsfaktorerna och ett deadenylas bryter ner mRNA. |
Nämn några skillnader mellan eukaryot och prokaryot translation. | Prokaryoter - Består av färre ribosomer (70s) och kräver färre translationsfaktorer. Dessutom har det ett poly-cistroniskt mRNA - där fler gener kan finns på samma mRNA. Translationsinitieringen är också annorlunda, prokaryoter känner igen en SD-sekvens i mRNA. |
Ge några exempel på mRNA-specifik translationsreglering (exempel förekommer i bakterier men med stor sannolikhet finns de också i eukaryoter.) | - Ett translations repressor protein kan vara i vägen och blockera för basparning - Startkodonet kan vara mer eller mindre tillgängligt för start, bindningen kan t.ex. variera vid olika temperaturer - En liten molekyl förskjuter jämvikten - ex. genom att förskjuta en avstängning - Ett annat RNA kommer och basparar och blockerar på så sätt för ribosomen |
Ge exempel på var och hur effektiviteten i proteinsyntesen kan regleras. | - Initieringen - Kan regleras ex. genom att en inhibitor på 5'ändan eller genom att störa kommunikationen mellan 5' cappen och 3' poly-A svansen - Elongeringen - MiRNA kan binda till mRNA och reducera proteinutmatningen - Vid stressfulla situationer (ex. hastig temperaturförändring, påverkan av virus m.m.) kan proteinsyntesen minska - Stor del av denna minskning beror på fosforylering av translations initiatorfaktorn eIF2 |
Want to create your own Flashcards for free with GoConqr? Learn more.