En la parte interna de las moléculas se encuentran las bases nitrogenadas, sus dos cadenas están unidas por enlaces de hidrógeno entre pares de bases complementarias. La adenina se empareja con la timina y la guanina con la citosina.
Se podría decir que las principales consecuencias de estos emparejamientos son:
I. Una hebra de ADN o de ARN puede actuar como molde para dirigir la síntesis de una cadena complementaria.
II. Sintetizar en el ribosoma de la célula y secuencializar las bases complementarias con un fragmento de una de las cadenas de ADN
III. Los ácidos nucleicos son capaces auto-replicarse permitiéndoles funcionar como las moléculas de información fundamentales de la célula.
IV. Dar interacciones próximas del apilamiento de la bases de los aminoácidos.
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