O sistema fosfagênio é a "segunda" fonte de energia da célula muscular lembrando que o ATP(Adenosina Trifosfato) que já estava acumulado na célula seria a primeira a ser recrutada. Assim como o ATP a Fosfocreatina (Cr-P) é armazenada na célula muscular. Tanto o ATP como a Cr-P possuem grupamentos fosfatos, por isso denominados fosfagênios, quando esse fosfato é removido da molécula de Cr, ocorre grande liberação de energia, que é imediatamente disponível para ressíntese de ATP. Quando o exercício necessita uma alta demanda de energia, um exercício de alta intensidade, as reservas de ATP são imediatamente depletadas aumentando a concertação de ADP (Adenosina Difosfato) e Pi (Fosfato inorgânico). O aumento de ADP é um marcador do aumento da atividade da enzima CPK (Creatinafosfatoquinase), ou seja a enzima CPK quebra a molecula de Cr-P, liberando fosfato que pode ligar-se ao ADP e ressintetizar ATP. A Creatina que doou seu Pi, para o ADP voltar a ATP, irá ser refosforilada dentro do metabolismo aeróbio.
Este sistema apresenta uma duração média de 10 segundos e é a rota mais rápida para obtenção de energia durante a contração muscular.
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