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Describa la estrategia de enriquecimiento subyacente al
aislamiento de Azotobacter por parte de Beijerinck.
? ¿Por qué se añade sulfato (SO4
2−) a una columna de
Winogradsky?
? ¿Qué es el sesgo de enriquecimiento? ¿De qué manera la
dilución reduce el sesgo de enriquecimiento?
¿En qué se diferencia el método de dilución con agar de la
siembra por estrías para obtener colonias aisladas?
¿Cómo podemos aislar una bacteria con una morfología
exclusiva que está presente en un cultivo de enriquecimiento
en cantidad relativamente baja?
Qué se entiende por «alto rendimiento» en el cultivo de
microorganismos? ¿Cómo ha beneficiado esto a la microbiología?
¿En qué se diferencia la tinción de viables de colorantes como
el DAPI?
? ¿Qué es un gen reportero?
? ¿Por qué es incorrecto afirmar que la GFP es un método de
«tinción»?
? ¿Qué estructura celular es la diana de las sondas fluorescentes
en la FISH filogenética?
? La FISH y la CARD-FISH se pueden usar para revelar diversos
datos sobre las células en la naturaleza. Explique de qué datos
se trata.
¿Qué se puede concluir de un análisis por PCR/DGGE de una
muestra que produce una banda por PCR y una banda por
DGGE? ¿Y si produce una banda por PCR y cuatro bandas
por DGGE?
? ¿Qué resultado sorprendente se desprende de muchos
estudios moleculares de hábitats naturales usando el rRNA
16S como gen diana?
¿Qué es un filochip y qué información puede ofrecernos?
? ¿Cuáles son las ventajas y desventajas de la tecnología de
micromatrices respecto de la secuenciación de los productos
de la PCR?
? ¿Por qué, en general, los análisis de T-RFLP no capturan
completamente la diversidad de los filotipos en una muestra
ambiental?
¿Qué es un metagenoma?
? ¿En qué se diferencian los métodos genómicos ambientales
de los análisis ambientales de genes individuales, como
los basados en análisis de genes de rRNA 16S para la
caracterización de las comunidades microbianas?
? ¿Cómo se puede identificar las poblaciones celulares más
activas metabólicamente usando métodos de genómica
ambiental?
¿Por qué los radioisótopos son tan útiles para medir la
actividad microbiana?
? Si de pronto penetrara una gran cantidad de materia orgánica
en los sedimentos, ¿cómo cambiaría esto los perfiles de nitrato
y oxígeno en la Figura 18.23?
¿Cómo puede la composición 13C/12C de una sustancia revelar
su origen biológico o geológico?
? ¿Cuál es la explicación más sencilla de que los sulfuros lunares
sean isotópicamente similares a los de la Tierra primordial?
? ¿Qué composición isotópica de carbono se espera que tengan
los metanótrofos (bacterias que consumen metano)?
¿Cómo se puede usar el NanoSIMS para identificar una
bacteria fijadora de nitrógeno?
? ¿Cuáles son las ventajas y desventajas de la citometría de flujo
respecto de la microscopía para caracterizar una comunidad
microbiana?
? Cómo relaciona la MAR-FISH la diversidad microbiana y la
actividad?
¿Cómo se puede identificar un organismo que lleva a cabo un
proceso concreto mediante el sondeo con isótopos estables?
? ¿Qué método fundamental es necesario para aplicar la
genómica en células individuales?
? Si una bacteria fijadora de nitrógeno crece en presencia de
15N2, ¿su DNA será más pesado o más ligero que el de una
bacteria que no fije nitrógeno?
Citometría de flujo:
Columna de Winogradsky:
Cultivo de enriquecimiento:
DAPI:
Ecología microbiana:
Electroforesis de gel en gradiente
desnaturalizante (CGGE):
Filotipo:
Fraccionamiento isotópico:
Genómica ambiental (metagenómica):
Hibridación fluorescente in situ (FISH):
MAR-FISH:
Metaproteómica:
Metatranscriptómica:
Microautorradiograf ía (MAR)
Microsensor:
Naranja de acridina:
Nicho efectivo:
Nicho fundamental:
Pinzas de láser:
Proteína fluorescente:
Sesgo de enriquecimiento:
Sonda de ácido nucleico:
Sondeo con isótopos estables (SIP):
Técnica del número más probable
(NMP):
