La quimiosmosis en la fotosíntesis es distinta a la quimiosmosis de respiración celular en el aspecto de que:
Los protones de hidrógeno salen del tilacoide por medio de ATP sintetiza al espacio stroma para estimular la fosforilicación de ADP, mientras que la respiración celular, los protones deben entrar la matriz mitochondrial para luego fosforilizar ATP en el interior del organelo.
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