La energía entra al ecosistema en forma de luz, carbono orgánico y sustancias inorgánicas reducidas. La luz es utilizada por los fotótrofos para sintetizar ATP y nueva materia orgánica. La nueva materia orgánica contiene C, N, S, F, Fe y otros elementos dela vida. Este material orgánico recién sintetizado , junto con materia orgánica que entra al ecosistema desde el exterior, materia orgánica alóctona, alimenta la actividad catabólica de los organismos quimioorganótrofos .