TERMINOLOGÍA y REQUERIMIENTOS

Para representar la transcripción y comprender mejor el procesor se representa el ADN como dos líneas antiparalelas de modo que:

La hebra superior es la Hebra no molde o codificante o informativa con el extremo 5’ a la izquierda. Es la hebra no transcrita y también se llama hebra positiva (+)
La hebra inferior o hebra molde o no codificante. Es la que se transcribe. También se llama hebraantisentido o negativa (-) y tiene el extremo 3’ a la izquierda.
Numeración: los nucleótidos involucrados en la transcripción de un gen se numeran desde el primero que se transcribe y se asignan números positivos +1, +2, +3, etc y se dice que estan corriente abajo. Los que están hacia el extremo 5’ y que generalmente se encuentran en regiones con funciones reguladoras se les asignan números negativos (se suelen representar en los diagramas a la izquierda de las regiones que se transcriben), -1, -2, -3 y se dice que están corriente arriba.
Para la síntesis de un ARN se necesitan enzimas del tipo ARNpolimerasas y NTPs o nucleótidos trifosforilados. En procariotas y orgánulos subcelulares (mitocondrias y cloroplastos de eucariotas) se utiliza una sola ARN polimerasa para sintetizar los tres tipos de ARN celular (ARNm, ARNt y ARNr). Sin embargo en eucariotas hay tres tipos diferentes de ARNpolimerasas (I, II, III) para cada uno de los tipos de ARN. La ARN pol II es la que se encarga de la transcripción del ARNm y también de un tipo de ARN llamado snARN. Todas las ARN polimerasas son proteínas oligoméricas.

ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIÓN

INICIACIÓN

Es la etapa más compleja de la transcripción y es en ella en la que se da la mayor parte de la regulación. Requiere la separación de hebras en un lugar próximo al promotor en donde se encaje la ARN polimerasa. En esta región se constituirá la burbuja de transcripción y en ella también actúan helicasas.

Para que la iniciación se produzca también es necesaria la unión al ADN de factores de transcripción (TF) a los promotores.

Los promotores son regiones del ADN que regulan el inicio de la transcripción de un gen si a ellos se unen factores de transcripción (son proteínas o péptidos) de modo que se favorezca la unión de la ARN polimerasa II al punto de inicio.

El promotor basal es una secuencia que define el origen de la transcripción y se sitúa comúnmente corriente arriba en la posición -30. En esta región hay secuencias características como la secuencia TATA, caja TATA o caja de Hogness situada en la posición -15 a -25. Otra secuencia básica que se encuentra en los promotores es laseuencia iniciadora lnr situada sobre el propio origen, entrre -3 y +5. (en procariotas la caja es TATAAT).

Hay otro tipo de promotor, el promotor proximal situado entre -60 y -120 con cajas del tipo CAAT o GC.

Algunos genes tienen una regulación más compleja que depende de secuencias más alejadas del punto de inicio que la regulan la eficacia de la transcripción (que se haga con mayor o menor intensidad). Son las secuencias promotoras distales que se clasifican en dos grupos:

Potenciadores (enhancers): que estimulan la transcripción del gen en cuestión.
Silenciadores o inhibidores (silencers): tienen el efecto opuesto ya que compiten con los enhancers por unirse a estas secuencias promotoras distales.

Estas secuencias, los factores de transcripción, los enhancers y la ARN polimerasas constituye el complejo de iniciación. Así se forman los primeros enlaces fosfodiester y termina la etapa de iniciación.

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LA TRANSCRIPCIÓN