A la etapa prepatogénica también se le denomina periodo de incubación, pues se refiere al tiempo que tarda un germen o un agente en multiplicarse en el organismo invadido y causar daño. Si tomamos como ejemplo el catarro común, el periodo de incubación se da cuando una persona entra en contacto con el virus, pero no tiene ningún síntoma hasta que éste invade sus células y desencadena los mecanismos
que caracterizan a la enfermedad.

En la etapa patogénica se manifiesta los síntomas característicos de la enfermedad en el huésped. Mientras que en el catarro común predominan los estornudos, nariz tapada, dolor articular y a veces, fiebre en el caso de la hepatitis A la etapa patogénica se manifiesta por fatiga, orina oscura y vomito.

La tercera etapa, la de resolución, engloba los acontecimientos propios de la enfermedad que desencadenan la curación total, la curación con secuelas o la muerte. En el catarro común, la resolución es habitualmente hacia la curación total; en la hepatitis A —como la que padeció Juan—la evolución casi siempre es hacia la curación total pero es necesario realizan exámenes de laboratorio para garantizar que así sea.

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