Existem 7 proteínas:
NS1, NS2A, NS2B,
NS3, NS4A, NS4B e NS5
estão citadas as mais relevantes.
NS 1
Nota:
É encontrada na superfície de células infectadas
Está relacionada com a maturação viral: tem sido usada como diagnóstico na fase aguda da doença
Anticorpos contra a NS1 são fixadores do complemento, mas não são neutralizantes e estão relacionados com a destruição da célula pelo complemento
NS3
Nota:
Na porção terminal, possui duas enzimas relacionadas com a clivagem do peptídeo uno resultante da tradução (Trypsin-like proteinase e Signal peptidase),
Possui uma helicase relacionada com a replicação
NS5
Nota:
RNA polimerase dependente de RNA.
Estruturais
C
Nota:
É a proteína que compõe o capsídeo, e está fortemente associada ao material genético
Composta por arginina
E
Nota:
Maior proteína do envelope.
É responsável pela ligação viral ao receptor celular, possui epítopos indutores da formação de anticorpos neutralizantes.
Nota:
A clivagem de prM para M está relacionada com a liberação de partículas infectantes.
Não é glicosilada, mas a precursora é.