ciclo metabólico de importancia fundamental en
todas las células que utilizan oxígeno durante el
proceso de respiración celular
En estos organismos aeróbicos, el ciclo de Krebs
es el anillo de conjunción de las rutas metabólicas
responsables de la degradación y desasimilación
de los carbohidratos, las grasas y las proteínas en
anhídrido carbónico y agua, con la formación de
energía química.
Etapas
Reacción 1: Citrato sintasa (De oxalacetato a citrato
El sitio activo de la enzima, activa el acetil-CoA para
hacerlo afín a un centro carbonoso del oxalacetato.
el grupo tioéster (CoA) se hidroliza, formando así la
molécula de citrato.
La reacción es sumamente exoergónica (ΔG'°=-31.4 kJ/mol),
motivo por el cual este paso es irreversible.
El citrato producido por la enzima, además, es capaz de
inhibir competitivamente la actividad de la enzima.
permite una completa regulación del ciclo de Krebs completo, convirtiendo a la
enzima en una especie de marcapasos del ciclo
Reacción 2: Aconitasa (De citrato a isocitrato)
La aconitasa cataliza la isomerización del citrato a isocitrato, por
la formación de cis-aconitato
La enzima cataliza también la reacción inversa,
pero en el ciclo de Krebs tal reacción es
unidireccional a causa de la ley de acción de masa
las concentraciones (en condiciones
estándar) de citrato (91%), del
intermediario cis-aconitato (3%) y de
isocitrato (6%), empujan decididamente
la reacción hacia la producción de
isocitrato
En el sitio activo de la enzima está presente un clúster hierro-azufre
que, junto a algunos residuos de aminoácidos polares, liga el sustrato
la unión al sustrato se asegura por la presencia de un resto de
serina, de arginina, de histidina y de aspartato, que permiten sólo
la unión estereospecifica del citrato 1R,2S, rechazando la forma
opuesta.
Reacción 3: Isocitrato deshidrogenasa (De isocitrato
a oxoglutarato)
La isocitrato deshidrogenasa mitocondrial es una
enzima dependiente de la presencia de NAD+ y de
Mn2+ o Mg2+
la presencia de un ión bivalente, que forma un
complejo con los oxígenos del grupo carboxilo
en posición alfa, aumenta la electronegatividad
de esa región molecular
salida de una molécula de CO2, que conduce a la
formación de α-cetoglutarato, caracterizado por dos
carboxilos en las extremidades y una cetona en posición
alfa con respecto de uno de los dos grupos carboxilo.
Reacción 4: α-cetoglutarato
deshidrogenasa (De
oxoglutarato a Succinil-CoA)
Después de la conversión del isocitrato en
α-cetoglutarato se produce una segunda
reacción de descarboxilación oxidativa, que
lleva a la formación de succinil CoA
alfa-cetoglutarato deshidrogenasa está compuesta
de tres enzimas diferentes:
Subunidad E1: las dos cetoglutarato deshidrogenasas.
Subunidad E2: la transuccinilasa. (La subunidad E1 y E2
presentan una gran homología con las de la piruvato
deshidrogenasa.) * Subunidad E3: la dihidrolipoamida
deshidrogenasa, que es el mismo polipéptido presente
en el otro complejo enzimático.
Reacción 5: Succinil-CoA sintetasa
(De Succinil-CoA a succinato)
La citrato sintasa se sirve de un
intermediario con tal unión a alta
energía para llevar a cabo la fusión entre
una molécula con dos átomos de
carbono (acetil-CoA
La enzima succinil-CoA sintetasa se sirve de tal
energía para fosforilar un nucleósido difosfato
purinico como el GDP.
El primer paso de la reacción genera un nuevo
intermediario a alta energía, conocido como succinil
fosfato.
Una histidina presente en el sitio catalítico
remueve el fosfato de la molécula glucídica,
generando el producto succinato y una
molécula de fosfohistidina, que dona
velozmente el fosfato a un nucleósido
difosfato, recargándolo a trifosfato
sencialmente trasladar grupos fosfato hacia el
ATP, en una reacción catalizada por la enzima
nucleósido difosfoquinasa.
Reacción 6:
Succinato
deshidrogenasa
(De succinato a
fumarato
La parte final del ciclo consiste en la reorganización de
moléculas a cuatro átomos de carbono hasta la
regeneración del oxalacetato
Para que eso sea posible, el grupo metilo presente
en el succinato tiene que convertirse en un
carbonilo
extracción ulterior de energía mediante
la formación de FADH2 y NADH.
La primera reacción de oxidación es catalizada por el
complejo enzimático de la succinato deshidrogenasa
única enzima del ciclo que tiene como aceptor de hidrógeno al FAD en
vez de al NAD+. El FAD es enlazado de modo covalente a la enzima por un
residuo de histidina
única enzima del ciclo que tiene como aceptor de
hidrógeno al FAD en vez de al NAD+. El FAD es
enlazado de modo covalente a la enzima por un
residuo de histidina
Tal posición se debe a la implicación de la enzima en la cadena
de transporte de los electrones.
Los electrones pasados sobre el FAD se introducen
directamente en la cadena gracias a la unión estable entre la
enzima y el cofactor mismo
Reacción 7: Fumarasa (De fumarato a L-malato)
La fumarasa cataliza la adición en trans de un protón y un
grupo OH- procedentes de una molécula de agua
La hidratación del fumarato produce L-malato.
Reacción 8: Malato deshidrogenasa (De
L-malato a oxalacetato)
La última reacción del ciclo de Krebs
consiste en la oxidación del malato a
oxalacetat
La reacción, catalizada por la malato
deshidrogenasa, utiliza otra molécula
de NAD+ como aceptor de hidrógeno,
produciendo NADH.
La energía libre de Gibbs asociada
con esta última reacción es
decididamente positiva, a
diferencia de las otras del ciclo
La actividad de la enzima es remolcada por el consumo de oxalacetato por
parte de la citrato sintasa, y de NADH por parte de la cadena de transporte de
electrones.
otras rutas metabólicas
Catabolismo de los carbohidratos
La glucolisis degrada la glucosa ) en piruvato y un α-cetoácido
que contiene tres átomos de carbono
La glucolisis degrada la glucosa (y otras moléculas de seis átomos de
carbono) en piruvato y un α-cetoácido que contiene tres átomos de
carbono
pierde un átomo de carbono y se convierte en acetil-CoA mediante la piruvato desihdrogenasa
En el interior de la mitocondria, el acetil-CoA puede entrar en el ciclo de Krebs, como se describió
anteriormente
Catabolismo de las proteínas
En lo que concierne a las proteínas,
son degradadas mediante
mecanismos de proteolisis por
enzimas proteasas, que las trocean en
sus constituyentes fundamentales: los
aminoácidos
Algunos aminoácidos pueden constituir una fuente de energía, ya que
son convertibles en intermediarios del ciclo mismo, por ejemplo el
aspartato, la valina y la isoleucina
Otros, convertibles en moléculas glucídicas, pueden entrar en el ciclo pasando
por las rutas catabólicas típicas de los glúcidos, por ejemplo la alanina,
convertible en piruvato.
Catabolismo de los lípidos
En el catabolismo de los lípidos, los triglicéridos
son hidrolizados por enzimas lipasas para formar
ácidos grasos y glicero
En los organismos superiores,
el glicerol puede entrar en la
glucolisis a nivel hepático o ser
transformado en glucosa a
través de la hidroxiacetona
fosfato y el
gliceraldehído-3-fosfato,
siguiendo la ruta metabólica de
la gluconeogénesis
En muchos tejidos, especialmente en el
corazón, los ácidos grasos son degradados
mediante un proceso conocido como
beta-oxidación, que produce acetil-CoA,
reingresado a su vuelta en el ciclo de Krebs
La beta-oxidación también puede generar propionil-CoA, que
puede ser reingresado en la vía gluconeogénica hepática al
generar glucosa.
Cadena de transporte de electrones
Una no tendría sentido sin la
otra en cuanto que el ATP y el
GTP producidos por el ciclo es
escaso y la producción de
NADH y FADH2 llevaría a un
entorno mitocondrial
excesivamente reducido
mientras que la cadena respiratoria por sí sola necesitaría
una fuente de cofactores reducida para la oxidación del
entorno.
Esta respiración celular extrae energía del NADH y FADH2, recreando
NAD+ y FAD y permitiendo de tal modo que el ciclo continue
El ciclo de Krebs no usa oxígeno, que es utilizado en cambio en
la fosforilación oxidativa