El antigeno es capado por una celula APC, de alli es endocitado y se forma en endosoma, este endosoma que contiene el antigeno se une con un lisosoma y se form aun endolisosoma que contiene al antigeno y a las enzimas que son proteasas que van a cortar el antigeno para que queden apenas para el bolsillo del MHC clase 2, la enzima que mejor hace esto es la catepsina.
Por otro lado del cromosoma 6 esta saliendo ARN que va a sintetizar una cadena alfa y una cadena betta, a las que se les va a unir la calnexina para estabilizarlas, estas cadenas despues se van a unir pero aun son inestables ya que su unica forma estable es con el peptido ahí, entonces lo que pasa es que a su bolsillo se les une lo que llamamos la cadena invariante de varias funciones, este complejo viaja en vesiculas de golgi hasta que llega al endolisosoma y forma el endosoma tardio, que contiene los peptidos generados a partir del antigeno, el MHC clase 2 con su cadena invariante, enzimas lisosomales y HLA-DM una molecula no clasica del HLA. Ahora lo que pasa es que se va a hacer proteolisis de la cadena invariante por parte de las enzimas lisosomales, dejando solo un pequeño pedazo que no esta a su alcanze por estar dentro del bolsillo llamdo CLIP (Peptido de la cadena invariante), despues de esto el HLA DM va a favorecer la apertura del bolsillo haciendo que el clip sea desplazado por un peptido de mas afinidad por el bolsillo que el mismo, despues de esto se dan señales para que se lleve esta vesicula hacia la membrana y pueda interactuar con el CD4