Los virus puede replicarse de dos maneras, la fase o por el ciclo lisogénico

La replicación por medio del ciclo lítico ocurre de la siguiente manera:
: el virus se coloca sobre la superficie de la célula que va a ; cierta parte de la cápside se empalma con un de la membrana de la célula hospedera.

La segunda fase del ciclo lítico, consiste en:
Penetración: el virus inyecta su o ARN en la célula; la cubierta de queda afuera.

Biosíntesis: se inactiva el de la célula y esta solo obedece las instrucciones del ADN viral; de esta manera, la célula empieza a producir muchas de los componentes para formar nuevos virus.

La cuarta fase del ciclo lítico es la:
Maduración: Los componentes del virus se , es decir, una copia del genoma viral que fue sintetizado por la célula hospede se en cada una de las cápsides por esta.

La quinta fase del ciclo lítico consiste en la:
: La célula se rompe y libera una gran cantidad de nuevos virus llamados , los cuales infectan más células dentro del mismo organismo que sirven para propagar la hacia otros individuos. La célula hospedero muere.

Las formas de transmisión viral son muy variadas: por vía aérea cuando respiramos, cuando los ingerimos en los alimentos, los que obtenemos directamente de nuestras madres, los que adquirimos por contacto y los que se transmiten por picaduras de como los mosquitos, entre otras. La piel representa una impenetrable para un virus porque está conformada por capas de células muertas, y los virus necesitan células vivas para poder replicarse.

Una vez que los virus logran pasar las barreras físicas, los virus se enfrentan a su contraparte natural: el sistema inmunológico, que está dividido en sistema y . El primero se llama así porque es un sistema de defensa que todos los animales parecen tener desde el nacimiento. Está constituido por cuatro líneas principales de defensa: 1) los fagocitos, que son células blancas encargadas de “patrullar” los tejidos del cuerpo y eliminar desechos, restos celulares e invasores; 2) el sistema del complemento, conformado por diversas proteínas plasmáticas que trabajan en conjunto para destruir a los invasores y para dar la señal de alarma a otros miembros del “equipo defensivo” (este sistema es muy antiguo, incluso los erizos de mar que evolucionaron hace aproximadamente 700 millones de años lo tienen); 3) el sistema de alerta de , que son proteínas que se unen a pequeños receptores o cerraduras de la membrana celular y alertan sobre posibles ataques virales, en dicho caso la célula infectada cometerá suicidio (el término técnico es apoptosis); y 4) las células naturales asesinas, encargadas de destruir a todas las células que han sido infectadas por algún (la cuestión es que aún no se sabe cómo lo hacen)

Unos virus producen proteínas que interfieren o inhabilitan las señales moleculares de alerta celular. A veces bloquean el sistema de para interrumpir la programación de muerte celular de un célula infectada; así, la célula sobrevive lo suficiente para replicar una gran cantidad de nuevos virus.

El sistema inmune adaptativo (células B) tiene memoria para reconocer los tipos virales a los que ha sido expuesto el individuo, pero las altas tasas de permiten que los virus cambien rápidamente, por lo que este sistema puede perder la capacidad de reconocerlos.

Al momento de replicar su material genético, el cual a veces está dividido en segmentos, algunos virus similares pero con diferente origen (por ejemplo, los virus de influenza humana e influenza aviar) pueden mezclarse o recombinarse cuando infectan simultáneamente una célula dentro de un individuo de la misma o de diferente especie (como el cerdo), por lo que el sistema inmune tampoco tiene contra esta nueva variante.

Los virus pueden utilizar “disfraces” para esconderse de los sistemas de defensa celular; por ejemplo, los rotavirus generan una triple capa proteínica que protege su material genético, pero únicamente la más externa es eliminada por enzimas y el material genético se mantiene escondido del sistema inmune dentro de las otras dos envolturas.

Existen rutas alternativas de infección; por ejemplo, el virus de la hepatitis A entra por vía oral, pero después toma un atajo para llegar al hígado, donde se replica en grandes cantidades. Como el sistema de defensa contra es diferente al que defiende los órganos internos y la sangre, el virus se replica durante el tiempo que le toma al sistema de defensa darse cuenta de que ha sido

A través de la de varias células del hospedero, en las que se forman aglutinaciones conocidas como células , puede ocurrir directamente la transmisión viral sin que el virus se exponga al sistema inmune.

Otros virus optan por la de células de defensa que regulan la coordinación de la respuesta inmunológica.

Unos virus producen para distraer al sistema inmune. Por ejemplo, el virus de la hepatitis B produce muchas envolturas virales sin material genético, entonces el sistema de defensa reconoce estas cajas vacías por las de su superficie, pero no puede distinguir entre las reales y los señuelos, así que muchos virus escapan

En el genoma humano se han descubierto secuencias de retrovirus que regulan la expresión de genes como los que codifican para la producción de (proteína importante para la piel y los ojos), los que producen la paratiroidea (que regula la concentración de calcio en la sangre) y los de la enzima (utilizada para digerir almidón y producir azúcares).

Se sabe que los retrovirus generan diferentes tipos de en los , lo cual impulsa una fuerza creativa en la historia de las diferentes especies de vertebrados a las que infectan.