Contemporary Lab Skills - Exam 2

Pregunta 1 de 100

1

What does PCR stand for?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Polymerase Chain Reaction
Polyamorous Consensual Relationship
Polymorphic Chain Reaction
Polymorphic Contrasting Reaction

Explicación

Pregunta 2 de 100

1

Selecciona la opción correcta del menú desplegable para completar el texto.

PCR is typically the ( first, second, third, last ) step in DNA analysis.

Explicación

Pregunta 3 de 100

1

What is the main significance of PCR vs other methods?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

PCR avoids the DNA cloning process
PCR promotes the DNA cloning process
PCR promotes the RNA cloning process
PCR avoids the RNA cloning process

Explicación

Pregunta 4 de 100

1

PCR amplifies all included DNA segments, which allows us to measure general information about the DNA, such as length and total composition.

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 5 de 100

1

What determines the segment of DNA that is amplified by PCR?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Primers
Template DNA
Buffer
dNTPs

Explicación

Pregunta 6 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

DNA amplification after PCR is ( less, greater ) than 10^( 6, 5, 10, 12 )x

Explicación

Pregunta 7 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

PCR amplification requires ( little, a large amount of ) template DNA, but is highly ( susceptible, resistant ) to contamination.

Explicación

Pregunta 8 de 100

1

______________ is a thermostable DNA polymerase used to automate the repetitive steps in the polymerase chain reaction (PCR) technique.

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Taq polymerase
Qat polymerase
Thermopolymerase
Therm polymerase

Explicación

Pregunta 9 de 100

1

Which of the following is a requirement of PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Thermocycler
Template DNA
Primers
Thermostable DNA polymerase
Agarose Gel
Electric Current

Explicación

Pregunta 10 de 100

1

What kind of primers are used in PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Forward
Reverse
One-way
Two-way

Explicación

Pregunta 11 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

Using dNTP, or ( deoxynucleotide triphosphate, deoxynucleic triptophosphorous, deoxynucleotide triptophosphate, deoxynucleic triphosphate ), during the ( extension, replication, conditioning ) phase of PCR provides single bases ready to go into DNA and double it, like building blocks.

Explicación

Pregunta 12 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

DNA polymerases (DNAPs)...

- Add dNTPs to ( elongate, compress ) primer
- Require pre-existing ( oligonucleotide, phosphodiester ) (primer) with free ( 3' -OH, 5' -OH, 3' -PO4, 5' -PO4 )
- Read DNA template strand & inserts complementary ( deoxyribonucleotide (dNTP), DNA polymerase (DNAP), deoxyribose (dRTP) ) of the next unpaired nucleotide in the template
- Form ( phosphodiester, oligonucleotide, deoxyribonucleoide (dNTP) ) bond between ( 3' -OH, 5' -PO4, 5' -OH, 3' -PO4 ) of ( oligonucleotide, phosphodiester ) & ( 5' -PO4, 3' -OH, 3' -PO4, 5' -OH ) of ( deoxyribonucleotide (dNTP), oligonucleotide, phosphodiester )
- DNA synthesis proceeds ( 5'-->3', 3'-->5' )
- Template strand read ( 3'-->5', 5'-->3' )

Explicación

Pregunta 13 de 100

1

Select all that apply to DNA polymerases for PCR

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Thermostability is essential
Optimum polymerase activity at 72 degrees C, but can withstand up to 95 degrees C
Use exonuclease deficient forms
3'-->5' exonuclease activity may modify/degrade primers under initial sub-optimal conditions
Optimum polymerase activity at 65 degrees C, but can withstand up to 82 degrees C
Use endonuclease deficient forms
5'-->3' exonuclease activity may modify/degrade primers under initial sub-optimal conditions

Explicación

Pregunta 14 de 100

1

Match the DNA polymerases with their description

❌
- Taq Polymerase
- In hot springs

❌
- deep ocean vents
...- extends templates >12kb
...- proofreading ability
- Manipulation of Vent -->Deep Vent
...- Greater thermostability
...-Lacks exonuclease (exo-) component

❌
- Extends long templates
- Proofreading ability

❌
- RT at 70 degrees C + Mn^2+
- similar to RNA-PCR without cDNA

❌
- Proofreading activity
- Efficiently incorporates radiolabeled dNTPs
- Good for generating DNA probes

Arrastra y suelta para completar el texto.

Thermus aquatics

Thermococcus litoralis

Thermus maritima (UITma)

Thermus thermophilus (Tth)

Pfu DNA polymerase (marine bacterium)

Explicación

Pregunta 15 de 100

1

How long are typical PCR primers?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

20-30 bp
30-40 bp
10-20 bp
40-50 bp

Explicación

Pregunta 16 de 100

1

Select all that apply to a good PCR primer

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

complement flanking DNA
not self-complementary
avoids potential secondary structure
matched GC content
similar melting temp
higher melting temp
complements itself
cannot complement flanking DNA
avoids potential tertiary structure

Explicación

Pregunta 17 de 100

1

Using software such as Oligo and Primer to calculate precise times and temperatures for PCR primer is an option, but calculations made by the researcher should be accurate enough.

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 18 de 100

1

Which of the following are major components in a PCR reaction mixture?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Target DNA
Primers
DNA Polymerase
dNTPs
Buffer appropriate for enzyme
dNADs
deoxyribonuclease

Explicación

Pregunta 19 de 100

1

Which of the following should be considered when choosing a buffer for PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

enzyme activity
primer/template binding
effective incorporation of dNTPs
optimization for Mg^2+
optimization for P^+
DNA length

Explicación

Pregunta 20 de 100

1

The PCR cycle has which three steps?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Denaturation
Annealing
Extension
Buffering
Contraction

Explicación

Pregunta 21 de 100

1

What is the significance of the denaturing phase of PCR?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

It allows the selected region for amplification to be accessible to enzymes
It allows primers to anneal to the template DNA
It extends the primers beyond the target DNA

Explicación

Pregunta 22 de 100

1

Denaturation of DNA occurs at what temperature?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

90 degrees C
80 degrees C
85 degrees C
75 degrees C

Explicación

Pregunta 23 de 100

1

Which of the following occurs during the annealing phase of PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

reaction mixture cooled to 40-65 degrees C
Primers anneal to template DNA
precise temperature is critical and must be defined to avoid synthesis of other products
template dsDNA denatured by heating above 90 degrees C
temperature is raised to 72 degrees C
primers extended beyond target DNA
Primers extended from 3' -OH by thermostable DNA polymerase

Explicación

Pregunta 24 de 100

1

Which of the following occurs during the extension phase of PCR

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Temperature is raised to 72 degrees C
Primers extended from 3' -OH by thermostable DNA polymerase
Primers extended beyond target DNA
Sequence at 3' end contains sequence complementary to other primer
reaction mixture cooled to 40-50 degrees C
Primers anneal to template DNA
Template dsDNA denatured by heating above 90 degrees C

Explicación

Pregunta 25 de 100

1

Successive PCR cycles yield fragments precisely delimited by the primer.

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 26 de 100

1

Which of the following applies to Agarose Gel electrophoresis (AGE) PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Run PCR products on gel alongside size standards
Look for band of predicted size
Original method
Semi-quantitative at best
Monitor accumulation of PCR products
Quantitative
Use fluorescent-labeled primers, probes, or fluorochromes
Based on Fluorescent Resonance Energy Transfer (FRET)

Explicación

Pregunta 27 de 100

1

Which of the following applies to Real-time PCR

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Monitor accumulation of PCR products during cycling
Quantitative
Use fluorescent-labeled primers, probes, or fluorochromes
Based on fluorescent Resonance Energy Transfer (FRET)
Run PCR products on gel alongside size standards
Look for band of predicted size
Orignal method
Semi-quantitative at best

Explicación

Pregunta 28 de 100

1

Label the types of Real-Time PCR

Arrastra la opción correcta a cada uno de los puntos naranjas

Light Cycler Primers

Molecular Beacons

UFO PCR

Photon Cycler Primers

Taqman PCR Assay

Reporter-Quencher Assay

Scorpion Assay

Inchworm Assay

Explicación

Pregunta 29 de 100

1

What is the main benefit of using PCR over cloning?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

PCR is faster
PCR produces more accurate results
PCR requires less preparation
PCR is generally cheaper

Explicación

Pregunta 30 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

In PCR, "RAPD" stands for...

( Rapid, Renentive ) ( Amplification, Annealing ) of ( Polymorphic, Phosphodiester ) DNA

Explicación

Pregunta 31 de 100

1

Which of the following applies to RAPD PCR Analysis?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

One or both primers are random sequences
Yields discrete bands on gel
Alteration in fragment length due to insertions/deletions between primer sites
Reproducibly identify and organism/species
Differentiate between various mutants
Based on insertions/deletions in gene sequence among individuals/genes
Amplification using 1 primer

Explicación

Pregunta 32 de 100

1

Which of the following applies to AFLP PCR analysis?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Based on insertions/deletions in gene sequence among individuals/species
PCR amplification of specific gene(s)
Type of DNA fingerprint analysis
Amplification using 1 primer
One or both primers are random sequences
Yields discrete bands on gels
Alteration in fragment length due to insertions/deletions between primer sites

Explicación

Pregunta 33 de 100

1

PCR is an effective replacement for cloning

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 34 de 100

1

Cloning PCR products involves which of the following?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

In vitro protein synthesis
In vivo protein synthesis
In vitro DNA synthesis
In vivo DNA synthesis

Explicación

Pregunta 35 de 100

1

What are the initial problems associated with Direct PCR sequencing?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

sequencing requires ssDNA
Short PCR products re-anneal rapidly
Prevent annealing of sequencing primers
Bias amplification for 1 strand (primer ratio 100:1)
Use denaturants
Selectively remove 1 strand after sequencing

Explicación

Pregunta 36 de 100

1

What are the solutions for problems associated with direct PCR sequencing?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Bias amplification for 1 strand (primer ratio 100:1)
Use denaturants
Selectively remove 1 strand after synthesis
Sequencing requires ssDNA
Short PCR products reanneal rapidly
Prevent annealing of sequencing primers

Explicación

Pregunta 37 de 100

1

Select all the denaturants used for direct PCR sequencing

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Formamide
Dimethylsulfoxide
Formaldehyde
Dihydrogen monoxide

Explicación

Pregunta 38 de 100

1

How is one strand selectively removed after synthesis during direct PCR sequencing?
(Select 2)

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Incorporate biotin into 1 primer
Affinity chromatography with bound streptavidin removes biotinylated strand
Incorporate formamide into 1 primer
HPLC chromatography with bound streptavidin removes biotinylated strand
HPLC chromatography with bound straptovitamin removes biotinylated strand

Explicación

Pregunta 39 de 100

1

This is a depiction of which kind of PCR sequencing?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Direct PCR sequencing
PCR cycle sequencing

Explicación

Pregunta 40 de 100

1

This is a depiction of which type of PCR sequencing?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

PCR cycle sequencing
Direct PCR sequencing

Explicación

Pregunta 41 de 100

1

Which of the following applies to PCR cycling?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Amplification using 1 primer
Uses about 20 PCR cycles to complete
Detected using Fluorescent ddNTPs
Detected using Radiolabeled ddNTPs
BIas amplification for 1 strand (primer ratio 100:1)
Use denaturants

Explicación

Pregunta 42 de 100

1

RT-PCR stands for...

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Reverse Transcriptase PCR
Reverse Terminal PCR
Repeating Transcriptase PCR
Repeating Terminal PCR

Explicación

Pregunta 43 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

Reverse Transcriptase converts ( mRNA, cDNA, ddDNA, rRNA ) to ( cDNA, mRNA, rRNA, ddDNA ) during RT-PCR.

Explicación

Pregunta 44 de 100

1

What are the steps of RT-PCR in the correct order?

❌
❌
❌
❌--Use cDNA in PCR

Arrastra y suelta para completar el texto.

Isolate Poly(A)-mRNA

Anneal Poly(dT) Primer to mRNA

Reverse Transcriptase Synthesis of cDNA

Remove RNA

Explicación

Pregunta 45 de 100

1

Electrophoresis is...

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

the separation of molecules using an electric field
the separation of molecules using a magnetic field
the visualization of molecules using an electric field
the visualization of molecules using a magnetic field

Explicación

Pregunta 46 de 100

1

The migration distance is primarily determined by the ___________ ratio

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

charge:mass
charge:size
density:mass
density:size

Explicación

Pregunta 47 de 100

1

What is the primary reason we use a matrix in electrophoresis?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

It increases resolution of molecules with a similar charge:mass ratio
It decreases the time it takes to complete electrophoresis
It allows the charges from the positive and negative ends to traverse the entire mechanism
It gives the molecules something to adhere to

Explicación

Pregunta 48 de 100

1

A matrix imposes a size constraint on molecule movement during electrophoresis

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 49 de 100

1

Select all that are common matrices for electrophoresis

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Agarose (AGE)
Polyacrylamide (PAGE)
Starch
Cellulose (TLE)
Silica (TLE)
Paper
Sodium hydrogen carbonate (SHC)

Explicación

Pregunta 50 de 100

1

Drag the types of electrophoresis to their applications

❌
- Proteins

Paper electrophoresis
- Small molecules

❌
- Small Molecules

❌
- Molecules dissolved in liquid

❌
- DNA (>2 kb)
- RNA (>2 kb)

❌
- DNA
- RNA
-Proteins
- Small molecules

❌ (PAGE)
- Small DNAs (<2 kb)
- Small RNAs (<2 kb)

Arrastra y suelta para completar el texto.

Starch gel electrophoresis

Thin-layer electrophoresis (TLE)

Free-flow electrophoresis

Agarose gel electrophoresis (AGE)

Capillary electrophoresis

Polyacrylamide gel electrophoresis

Explicación

Pregunta 51 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

For nucleic acid gel electrophoresis (separation of DNA and RNA), an ( agarose, polyacrylamide ) matrix is used for general applications while ( polyacrylamide, agarose ) is used for sequencing and footprinting.

Explicación

Pregunta 52 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

The phosphate in a nucleic acid's backbone has a strong ( negative, positive ) charge proportional to the ( number of base pairs (bp), size of base pairs (bp), proportion of bases (A/G/T/C) ), so it runs towards the ( positive, negative ) end of the electrophoresis matrix.

Explicación

Pregunta 53 de 100

1

Why is denaturing part of agarose electrophoresis?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Used to prevent the formation of secondary structure
Used to prevent the formation of tertiary structure
Used to prevent re-annealing
Used to prevent annealing

Explicación

Pregunta 54 de 100

1

Which of the following is used in denaturing agarose gels (DNA)

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

alkaline buffers
formamide
formaldehyde
methylmercuric hydroxide
Detergents (e.g. SDS)

Explicación

Pregunta 55 de 100

1

Which of the following is used in denaturing agarose gels (RNA)

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

formamide
formaldehyde
methylmercuric hydroxide
alkaline buffers
Detergents (e.g. SDS)

Explicación

Pregunta 56 de 100

1

Which of the following is used in denaturing acrylamide gels?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Detergents (e.g. SDS)
alkaline buffers
formamide
formaldehyde
methylmercuric hydroxide

Explicación

Pregunta 57 de 100

1

Polyacrylamide gels permit the resolution of individual bases

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 58 de 100

1

Pulsed-field electrophoresis (or orthogonal field electrophoresis) does not permit the separation of large DNAs.

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 59 de 100

1

Which of the following applies to pulsed-field electrophoresis?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

effectively separates small chromosomes >10^6 bp
uses electric field conducted through a stiff rod snaking through the gel
one can alter the orientation of the field
effectively separates large chromosomes <10^10 bp
uses electric field conducted through a liquid phase via two small rods on either end (one cathode, one anode)
the field is fixed and can only go in one direction

Explicación

Pregunta 60 de 100

1

Which of the following are general stains for nucleic acids?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Ethidium bromide (EtBr)
SYBRgreen
Psorelen
Methylene blue

Explicación

Pregunta 61 de 100

1

During electrophoresis staining of nucleic acids, the stain intercalates between the ___________ of the nucleic acids.

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

bases
phosphodiester bonds
-OH bonds

Explicación

Pregunta 62 de 100

1

Selecciona la opción correcta del menú desplegable para completar el texto.

Alignment of stain molecules to DNA after electrophoresis permits a strong fluorescent signal when stimulated with ( UV, gamma radiation, an electric field ).

Explicación

Pregunta 63 de 100

1

Proteins are typically separated by what kind of electrophoresis?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)
Agarose gel electrophoresis (AGE)
Capillary electrophoresis
Free-flow electrophoresis

Explicación

Pregunta 64 de 100

1

PAGE gels can come in what formats?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Slab gels
Rod (tube) gels
Box gels

Explicación

Pregunta 65 de 100

1

Selecciona la opción correcta del menú desplegable para completar el texto.

PAGE buffer systems can either be ( continuous or discontinuous, high or low charge, long or short, simple or complex ).

Explicación

Pregunta 66 de 100

1

Which of the following are components of a polyacrylamide gel?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Acrylamide
BIs-acrylamide
Buffer
Denaturants (optional)
Agarose

Explicación

Pregunta 67 de 100

1

Which of the following are catalysts used for polymerization of PAGE preparation?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Ammonium persulfate (APS)
N,N,N'N'-Tetramethylenediamine (TEMED)
Bis-acrylamide
Acrylamide

Explicación

Pregunta 68 de 100

1

What are the functions of the catalysts used during PAGE preparation?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

TEMED forms free radicals from APS
APS forms free radicals from TEMED
Bis-acrylamide forms free radicals from acrylamide
Acrylamide forms free radicals from bis-acrylamide

Explicación

Pregunta 69 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

In PAGE gel preparation the free radicals made from the catalysts form form linkages from ( acylamide, TEMED, APS ) to acrylamide and ( acrylamide, TEMED, APS ) to ( bis-acrylamide, TEMED, APS ).

Explicación

Pregunta 70 de 100

1

Which of the following can inhibit APS/TEMED catalysts during PAGE gel preparation?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

low pH
oxygen
high pH
water

Explicación

Pregunta 71 de 100

1

Select all that apply to %T

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

= Total acrylamides in gel (w/v)
= % Acrylamide + % Bis-acrylamide
Increased %T --> decreased pore size
= Cross-linkers in gel (w/v)
= % Bis-acrylamide
Increased %T --> increased pore size

Explicación

Pregunta 72 de 100

1

Select all that apply to %C

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

= Cross-linkers in gel (w/v)
= % Bis-acrylamide
Increased %C --> decreased pore size
= Total acrylamides in gel (w/v)
= % Acrylamide + % BIs-acrylamide
Increased %C --> increased pore size

Explicación

Pregunta 73 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

In a discontinuous buffer system...

Velocity of Migration = ( Effective Mobility, Size ) x ( Voltage, Mass )
- Proportion of charged molecules determines effective mobility

Voltage = ( Current, Charge ) x ( Resistance, Reactability )
- V = I x R

Proteins accumulate in a ( narrow, wide ) band (i.e. ( Stack, Resolution )) before entering the ( resolving, stacking ) gel

Stacking gels have ( large, small ) pores (( low, high ) %T, ( no molecular sieving, molecular sieving )) and a pH of ( 6.8, 8.8, 8.6, 6.6 ).
Glycine is ( protonated, deprotonated, differentially deprotonated ), so it has a ( slow, fast, intermediate ) migration and is the ( trailing, leading ) ion. Proteins are ( differentially deprotonated, protonated, deprotonated ), so they have an ( intermediate, slow, fast ) migration. Chloride (Cl-) has ( high, low ) mobility and is the ( leading, trailing ) ion.

Cl- moves ( away from, towards ) the glycine, creating a ( low, high ) conductivity zone. The ( low, high ) conductivity zone attains a ( higher, lower ) voltage gradient. At its steady-state, glycine and Cl- are moving at ( the same rate, different rates ) with a ( sharp, undefined ) boundary between them. As the glycine moves through the stacking gel, the ( Cl-, proteins )overtakes the ( proteins, Cl- ) ( in front of, behind ) the boundary. Proteins have ( higher, lower ) mobility than glycine in the trailing ( high-voltage, low-voltage ) gradient, so they move ( at, behind, in front of ) the boundary.

Resolving gels have ( smaller, larger ) pores (( higher, lower ) %T, ( molecular sieving, no molecular sieving )) and a pH of ( 8.8, 6.8, 6.6, 8.6 ). At the resolving gel, glycine ( deprotonates, protonates ) and ( increases, decreases ) mobility. The ( glycine, proteins ) overtakes the ( proteins, glycine ) and moves just behind the Cl-. Then the Proteins separate based on their ( charge:mass ratio, mass ) and molecular sieving due to gel composition (%T, %C).

Explicación

Pregunta 74 de 100

1

Denaturing protein electrophoresis is generally conducted using _________ to separate proteins.

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

SDS-PAGE
Urea gels
Starch gels
Sucrose gels

Explicación

Pregunta 75 de 100

1

The "SDS" in SDS-PAGE stands for...

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

sodium dodecylsulfate
sodium dioxycarbonate
sodium dioxysulfate
sodium dodecylcarbonate

Explicación

Pregunta 76 de 100

1

Select all that apply to the SDS detergent used in SDS-PAGE

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Linearizes protein
Coats protein with negative charges
Coats protein with positive charges
Compresses protein

Explicación

Pregunta 77 de 100

1

SDS-PAGE requires __________ for complete disruption of secondary structure

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

a reducing agent
a buffer
a catalyst

Explicación

Pregunta 78 de 100

1

Which of the following are examples of reducing agents used during SDS-PAGE?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

beta-Mercaptoethanol (BME)
Dithiothreitol (DTT)
Dithioerythritol (DTE)
Sodium dodecylsulfate
Ampholytes

Explicación

Pregunta 79 de 100

1

Selecciona la opción correcta del menú desplegable para completar el texto.

When using an SDS detergent for PAGE...

Separation is based on ( chain length, chain linearization, chain charge )
It has a slightly negative charge at pH 7, so the molecules run towards the positive pole

Explicación

Pregunta 80 de 100

1

Which of the following applies to Urea gels during denaturing protein electrophoresis?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Disrupts hydrogen bonds (H-bonds) to for primary structure
Does not alter charges on protein for the given buffer system and pH
Separation is based on the charge:mass ratio
Alters charges on protein for the given buffer system and pH
Creates hydrogen bonds (H-bonds) for secondary structure
Separation is based on the chain length
Sometimes used for 1st dimension of 2D-PAGE

Explicación

Pregunta 81 de 100

1

Which of the following are examples of gel matrices used for non-denaturing protein electrophoresis?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

polyacrylamide
starch
Sucrose
Glucose

Explicación

Pregunta 82 de 100

1

Which of the following are examples of native gels used for non-denaturing protein electrophoresis?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Sucrose
Glucose
Polyacrylamide
Starch

Explicación

Pregunta 83 de 100

1

Select all that apply to native gels

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Separation by charge:mass ratio
Maintain protein activity
Halt/dampen protein activity
Separation by chain length

Explicación

Pregunta 84 de 100

1

Select all that apply to isoelectrofocussing (IEF) gels

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Separation based on pI of protein
Ampholytes generate pH gradient
Proteins migrate to isoelectric point
Used during non-denaturing protein electrophoresis
Used during denaturing protein electrophoresis
Separation based on charge:mass ratio
Glycine and Cl- generate charge gradient

Explicación

Pregunta 85 de 100

1

Which of the following are examples of protein stains? (Drag to correct spot)

Standard: ❌
❌
Most sensitive: ❌

Arrastra y suelta para completar el texto.

Coomassie Brilliant Blue

Methylene Blue

Ruby Red

Sybergreen

Silver

Explicación

Pregunta 86 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

( Protein stains, Autoradiography ) (is/are) used for total protein visualization in electrophoresis (steady-state).

( Autoradiography, Protein stains ) (is/are) used for visualizing newly synthesized proteins after electrophoresis.

Explicación

Pregunta 87 de 100

1

Select all that apply to Autoradiography

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Used for In vivo labeling
Visualizes bands with x-ray film
Intensifying screens
increased spot density means increased quantity in band
Increased spot density means decreased quantity in band
Visualizes bands with UV light

Explicación

Pregunta 88 de 100

1

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

Rf = Distance of ( Migrated Band, Migrated Dye ) / Distance of ( Migrated Dye, Migrated Band )

Explicación

Pregunta 89 de 100

1

Migration in SDS-PAGE should be determined with a _________ function

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

linear
logarithmic

Explicación

Pregunta 90 de 100

1

Rf is typically used when molecular weight markers (MWM's) run on the gel with the sample.

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 91 de 100

1

2D enhanses esolution over 1D PAGE.

Selecciona uno de los siguientes:

VERDADERO
FALSO

Explicación

Pregunta 92 de 100

1

Why do we use 2-Dimensional Gel Electrophoresis?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

A 1D band may contain several proteins, so 2D resolves overlying proteins.
1D just seemed so boring that we had to add another dimension. It is the 21st century, after all.
1D band only transports the proteins halfway; 2D is needed for the proteins to travel the rest of the gel.

Explicación

Pregunta 93 de 100

1

Select all that apply to protein separation in the first dimension (electrophoresis).

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

IEF or native gel
separation based on charge:mass ratio
ampholytes generate pH gradient
proteins migrate to isoelectric point
separate on SDS-PAGE gels
separation based on size
posttranslational modifications occur

Explicación

Pregunta 94 de 100

1

Select all that apply to protein separation in the second dimension (electrophoresis).

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

separate on SDS-PAGE gels
separation based on size
Look for reproducible results
Posttranslational modifications occur
IEF or native gel
Separation based on charge:mass ratio
Proteins migrate to isoelectric point

Explicación

Pregunta 95 de 100

1

Why do posttranslational modifications occur after separation in the second dimension (electrophoresis)>

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

ARG & mature spot may not be the same
proteins don't follow the laws of physics during electrophoresis
proteins migrate to the isoelectric point, not based on size

Explicación

Pregunta 96 de 100

1

Select all components of In vitro translation systems (electrophoresis)

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

ribosomes
protein synthesis factors
tRNAs
mRNA
Amino acids (one radiolabeled)
rRNA
cDNA
Ampholytes

Explicación

Pregunta 97 de 100

1

What are the uses of In vitro translation of proteins?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Analyze major mRNAs present
Pro-protein production
Resolves overlying proteins

Explicación

Pregunta 98 de 100

1

What is the basic procedure of In vitro translation of proteins?

1. ❌
2. ❌

Arrastra y suelta para completar el texto.

Extract mRNAs

Copy mRNAs

Translate mRNAs In vitro

Label mRNAs In vitro

Explicación

Pregunta 99 de 100

1

___________ is the transfer of macromolecules from gel to membrane filter following electrophoresis.

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Blotting
Translation
Visualization
Staining

Explicación

Pregunta 100 de 100

1

What are some of the advantages of analyzing macromolecules using probes instead of in gels?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

More sensitive detection
Need less DNA/RNA/protein to complete
Probe detects only molecule of interest (not all molecules on gel visualized)
Reduce volumes of expensive reagents
Probes make you feel like a cool alien
Faster visualization

	Creado por Jo O'Bar hace más de 3 años

Covering Polymerase Chain Reaction, Electrophoresis, and more

Contemporary Lab Skills - Exam 2

Pregunta 1 de 100

What does PCR stand for?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 2 de 100

Selecciona la opción correcta del menú desplegable para completar el texto.

PCR is typically the first second third last( first, second, third, last ) step in DNA analysis.

Explicación

Pregunta 3 de 100

What is the main significance of PCR vs other methods?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 4 de 100

PCR amplifies all included DNA segments, which allows us to measure general information about the DNA, such as length and total composition.

Selecciona uno de los siguientes:

Explicación

Pregunta 5 de 100

What determines the segment of DNA that is amplified by PCR?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 6 de 100

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

DNA amplification after PCR is less greater( less, greater ) than 10^6 5 10 12( 6, 5, 10, 12 )x

Explicación

Pregunta 7 de 100

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

PCR amplification requires little a large amount of( little, a large amount of ) template DNA, but is highly susceptible resistant( susceptible, resistant ) to contamination.

Explicación

Pregunta 8 de 100

______________ is a thermostable DNA polymerase used to automate the repetitive steps in the polymerase chain reaction (PCR) technique.

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 9 de 100

Which of the following is a requirement of PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 10 de 100

What kind of primers are used in PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 11 de 100

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

Explicación

Pregunta 12 de 100

Selecciona la opción correcta de los menús desplegables para completar el texto.

Explicación

Pregunta 13 de 100

Select all that apply to DNA polymerases for PCR

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 14 de 100

Arrastra y suelta para completar el texto.

Explicación

Pregunta 15 de 100

How long are typical PCR primers?

Selecciona una de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 16 de 100

Select all that apply to a good PCR primer

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 17 de 100

Using software such as Oligo and Primer to calculate precise times and temperatures for PCR primer is an option, but calculations made by the researcher should be accurate enough.

Selecciona uno de los siguientes:

Explicación

Pregunta 18 de 100

Which of the following are major components in a PCR reaction mixture?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 19 de 100

Which of the following should be considered when choosing a buffer for PCR?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 20 de 100

The PCR cycle has which three steps?

Selecciona una o más de las siguientes respuestas posibles:

Explicación

Pregunta 21 de 100

PCR is typically the ( first, second, third, last ) step in DNA analysis.

DNA amplification after PCR is ( less, greater ) than 10^( 6, 5, 10, 12 )x

PCR amplification requires ( little, a large amount of ) template DNA, but is highly ( susceptible, resistant ) to contamination.

In PCR, "RAPD" stands for...

( Rapid, Renentive ) ( Amplification, Annealing ) of ( Polymorphic, Phosphodiester ) DNA