Ciència que estudia la herencia biològica i la variació i transmissió d'informació
Àcids nucleics
Macromolècules biològiques de caràcter àcid que es van
descobrir a l'interior del nucli de les cèl·lules eucariotes. Són
polímers formats per la unió de nucleòtids.
Composició química dels nucleòtids
Grup trifosfat.
Unit al carboni 5' de la
pentosa per un enllaç èster
fosfòric
Base nitrogenada.
Unida al carboni 1' de la pentosa per
un enllaç N- glicosídic
2 tipus
Púriques. Adenina i Gunanina.
Deriven de una molècula de
purina. Estan unides a la pentosa
pel N 9
Pirimídiniques. Citosina, Timina i
Uracil. Deriven d'una molècula de
pirimidina. Estan unida a la pentosa
pel N1
Pentosa.
2 tipus
Ribosa. Es troba en
els nucleòtids del
RNA
RNA més inestable
que DNA (alcohol en
2' podria hidrolitzar
l'enllaç fosfodièster)
2-desoxiribosa. Es troba
en els nucleòtids del
DNA
A-T = 2 ponts H.
C-G= 3 ponts H
Cadenes àcids nucleics
2 extrems:
Extrem 5'. Hi ha grup fosfat unit al
carboni 5' del primer nucleòtid
Extrem 3'. Hi ha un radical hidroxil
unit al carboni 3' de l'últim
nucleòtid.
Últim radical està lliure, no
participa en cap enllaç
Els àcids nucleics es sintetitzen mitjançant
POLIMERASES (enzims) que afegeixen nucleòtids a
l'extrem 3'.
Entre el radical hidroxil del carboni 3' de l'últim
nucleòtid i el radical fosfat del carboni 5' del nucleòtid
que s'afegeix es forma un enllaç fosfodièster.
Per llegir cadena DNA -> direccionalitat 5'>>>3'
DNA, àcid desoxirribonucleic
Constituït per cadenes de nucleòtides
enrotllades formant una hèlix doble. Cada
cadena està fromada per un polímer de
desoxirribonucleòtids d'A, T, C ,G. NO U. Mm
molt elevada. Està carregat NEGATIVAMENT
Model de la doble hèlix establert
per Watson i Crick.
Les dues cadenes complementàries estableixen interaccions pont
d'hidrogen entre les bases nitrogenades de cadenes diferents
Els esquelets sucre-fosfat es troben a l'exterior de l'hèlix, i les
bases nitrogenades a l'interior.
Les cadenes de DNA són antiparal·leles (enllaços 5'->3' en
sentits contraris)
DNA s'enrotlla en histones gràcies a les interaccions a
causa de l'aciditat del DNA.
Donen
estabilitat
Les cadenes amb més
bases C i G tindran T de
desnaturalització més
alta, perquè tenen més
interaccions pont H que
A i T
n A = n T
n C = n G
Flux de la informació
genètica
Replicació.
DNA polimerasa
depenent de DNA
DNA -> DNA
Només es
produeix quan
la cèl·lula s'ha
de dividir
Transcripció.
RNA polimerasa
depenent de DNA
DNA ->
RNA
Es produeixen
moltes vegades en
la vida d'una
cèl·lula
Traducció.
Ribosomes
RNA ->
proteïna
Mecanisme de duplicació de DNA
Procés pel qual una doble hèlix de
DNA és copiada per tal d'originar
dues molècules idèntiques a la
progenitora. És un procés
semiconservatiu i semidiscontinu,
ordenat i seqüencial, que requereix
de substrats activats.
Semiconservativa
Perquè cada cèl·lula
progenitora transmet una
cadena de DNA, a partir de la
qual la filla farà la seva
complementària. Una de les
cadenes és la original i l'altra
és la còpia
La complementarietat entre
bases serveix a la DNA
polimerasa per saber quin
desoxinucleòsid triar i és el
fonament de la replicació
semiconservativa
Ordenada i seqüencial
Les dues cadenes filles
de DNA es sintetitzen
SEMPRE en la direcció 5'
-> 3'.
La rx de polimerització es produeix per un
atac nucleofílic del grup 3' -OH de la
cadena que s'esta sintetitzanr sobre el
fosfat alpha del desoxinucleòsid trifosfat
que entra
La cadena que
serveix de motlle
es llegeix en la
direcció 3'-5'
Necessita substrats activats
Encebador.
Petita cadena de RNA a partir de la
qual la DNA polimerasa III copiarà la
cadena. Més tard, la DNA polimerasa
I substituirà el RNA per DNA.
RNA polimerasa
(primasa).
És el primer, encebador, coneguda
com a primasa. Afegeix bases
complementàries al començament
perquè la DNA polimerasa pugui
començar a copiar.
És un primer
Semidiscontínua
Fragments d'Okazaki.
Fragments de DNA copiats que es
sintetitzen de 5' a 3' discontínuament a
partir d'encebadors de RNA que més tard
seran eliminats
RUPLICACIÓ EN
PROCARIOTES
1. Fase d'iniciació.
Hi ha una seqüència de
nucleòtids de DNA,
anomenada "origen de la
replicació", que actua com a
senyal d'iniciació de tot el
procés de duplicació.
El procés s'inicia amb l'enzim HELICASA, que trenca
els ponts d'H entre les dues cadenes de DNA i les
separa, obre la forqueta. Les TOPOISOMERASES
eliminen les tensions i els superenrotllaments que
es produeixen en la molècula en trencar-se la
doble hèlix. Les PROTEÏNES ESTABILITZADORES
(SSB) mantenen la separació de les dues cadenes
complementàries, i s'inicia la FORQUETA DE
REPLICACIÓ
El procés és bidireccional, hi ha una
helicasa que treballa en un sentit i una
altra en el sentit contrari. Les dues
forquetes de replicació enfrontades
formen les BOMBOLLES DE REPLICACIÓ
Enzims que hi
participen
RNA polimerasa
(primasa)
Helicasasa
Topoisomerases
DNA polimerasa I
2. Fase
d'elongació
En aquesta fase, a més dels
enzims anteriors, també
intervenen les RNA-POLIMERASES
i les DNA-POLIMERASES
La PRIMASA sintetiza un
fragment curt de RNA
format per uns deu
nucleòtids, anomenat
ENCEBADOR O PRIMER
Després, la DNA-POLIMERASA III, partint de
l'encebador, comença a sintetitzar una
nova cadena de DNA en sentit 5'->3'. Té
creixement continuu, s'anomena CADENA
AVANÇADA
Sobre, l'altra cadena, la RETARDADA, la
RNA-POLIMERASA sintetitza aprox 40
nucleòtids d'RNA en un punt que dista
uns mil nucleòtids de la senyal
d'iniciació. A partir d'aquests
nucleòtids la DNA-POLIMERASA III
sintetitza aprox mil nucleòtids de DNA,
i es forma un FRAGMENT D'OKAZAKI.
Aquest procés es
va repetint a
mesura que es van
separant les dues
cadenes del DNA
Posteriorment hi intervé la
DNA-POLIMERASA I, que retira els
segments d'RNA i afegeix nucleòtids de
DNA al seu lloc.
Finalment hi intervé la DNA-LLIGASA,
que uneix els diferents fragments de
DNA sintetitzats. La DNA-POLIMERSA
II té activitat reparadora, corregint
errors
Síntesi de la cadena
retardada
La DNA-POLIMERASA I en
bacteris té activitat 5'
EXONUCLEASA, i elimina els
ribonucleòtids de
l'encebador i els substitueix
per desoxiribonucleòtids
Elimina els encebadors de
RNA formats durant la
replicació mitjançant la
seva activitat 5'->3'
exonucleasa
Repara el DNA
mitjançant la seva
activitat 3'->5'
exonucleasa
Substitueix el RNA
encebador per DNA
mitjançant la seva activitat
polimerasa
La DNA-LLIGASA catalitza
la formació de l'enllaç
fosfodièster entre els
extrems 3' i 5'
Enzims que hi
participen
Primasa
DNA-polimerasa
III
RNA-polimerasa
DNA-polimerasa
I
DNA-lligasa
DNA-polimerasa
II
3. Fase d'acabament
En E. coli la replicació acaba en
la regió TER, on s'uneix la
proteïna Tus bloquejant les
forquetes de replicació
Enzims en la replicació
Exonucleases. Tenen
activitat de degradació
de l'àcid nucleic
començant per un dels
extrems: o 5'-3' o bé
3'-5'.
Les DNA-POLIMERASES tenen activitat
3'-5' exonucleasa, que permet corregir
errors en la síntesi del DNA
DNA-polimerasa III
Primcipal enzim de la replicació.
Està formada per deu o més tipus
de subunitats. El nucli catalític de
la polimerasa consisteix en tres
subunitats
Sub. alpha. Conté el complex d'activitat DNA-polimerasa.
Sub. epsilon. Té activitat 3'-5' exonucleasa.
Sub. theta.
+ 7 subunitats per formar un
enzim làbil compost de
subunitats, conegut com
holoenzim DNA-polimerasa III
Endonucleases. Poden
començar la digestió del
DNA des de qualsevol
punt
Passar d'una seqüència
de nucleòtids a
aminoàcids
Transcripció
Procés de síntesi enzimàtica d'un RNA amb
seqüència complementària a un segment de
DNA. Es du a terme on es troba el DNA cel·lular o
genoma. En les cèl·lules eucariotes és al nucli. En
aquest procés, partir de la seqüència de
nucleòtids d'un gen (DNA) es realitza una còpia
amb la seqüència de nucleòtids complementaris
corresponents a un mRNA. Hi ha més errors que
en la replicació, degut que aquest únicament es
produeix un cop a la vida de la cèl·lula mentre
que en la transcripció es du a terme més d'un.
Aquest flux d'informació va ser proposat per crick en
els anys 50 com el dogma central de la biologia
molecular
Posteriorment es va descobrir que els virus que tenen RNA
com a material genètic (retrovirus) consititueixen una
excepció a aquest dogma. En aquest cas, la molècula d'RNA
funciona com a motlle per a la síntesi de DNA per mitjà de
l'enzim TRANSCRIPTASA INVERSA. Aquest enzim és capaç de
transferir la informacoó de l'RNA víric a una còpia de DNA en
un procés anomenat TRANSCRIPCIÓ INVERSA. Una altra
excepció la constitueixen els virus amb RNA capaços de
generar RNA complementaris mitjançant l'enzim REPLICASA
D'RNA.
Traducció
Es du a terme als ribosomes i s'obté una
seqüència d'aminoàcids a partir de la seqüència
de ribonucleòtids de l'mRNA obtingut en la
transcripció.