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2202049
Abrir BLAST N
Descrição
Mapa Mental sobre Abrir BLAST N, criado por jhonnylml em 06-03-2015.
Sem etiquetas
blast
blast n
mapas de restricción
pcr
Mapa Mental por
jhonnylml
, atualizado more than 1 year ago
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Menos
Criado por
jhonnylml
quase 10 anos atrás
7
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Resumo de Recurso
Abrir BLAST N
Usar BLAST n para buscar identidades con el primer oligo
Usar BLAST n para buscar identidades con el segundo oligo
Verificar que sea la CDS del mismo gen en ambas búsquedas
Cálculo del producto amplificado
La mayor posición del REVERSE menos la menor posición del FORWARD
Entrar en el ID de la secuencia
Cambiar la región mostrada a la amplificación de los primers (804 a 1591)
Convertir a formato FASTA la región amplificada
Copiar la secuencia y pegarla en el NEB cutter
Analizar el mapa de restricción y seleccionar Custom digest
Seleccionar la enzima definida por el artículo (MspA 1I)
Elegir el gel de agarosa al 2% y visualizar en el gel la simulación.
Analizar el patrón de bandas generado y su longitud
Se observan 4 bandas de longitud:
343pb, 304 pb, 73pb y de 68pb
Razonar qué ocurriría si no existe un corte en la posición 141 del producto amplificado, o bien 945 del gen, equivalente a el codón 315
Al eliminarse el corte entre la posición 141 y la 142, las bandas generadas aquí no se separarían:
Entonces la de 68pb y la de 343pb permanecen juntas, generando:
Sólo 3 bandas de la siguiente longitud:
411pb, 304pb y de 73pb.
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