Le Ficoll est:
Est le produit ajouté à du sang pour permettre la lyse des cellules
Après centrifugation est la partie du tube sanguin contenant le plasma
Avant centrifugation est la partie contenant le sang
Est un polysaccharide permettant le gradient de cellule lors de la centrifugation
Est une colle à bois utilisée pour monter des chapiteaux de cirque
Le détergent permet la lyse des cellules dans le but de purifier l'ADN
Est synonyme d'amorce:
Sonde
Patron
Oligonucléotide
Primer
Les ddNTPs:
Sont des nucléotides n'ayant pas d'extrémité 3'-OH
Sont des nucléotides à qui il manque la base azotée
Sont des nucléotides qui empêchent une polymérisation de l'ADN
Sont des nucléotides qui ne peuvent pas former de liaison phosphodiester
La méthode de séquençage utilisait la fluorescence mais utilise maintenant la radioactivité
La séquence référence du génome humain:
Compte ~3 milliards de paire de base
Est diploïde
15% manque à la séquence
Les parties manquantes sont dues à des régions non séquencée ou à des séquences répétées
Les segmental duplication:
Peuvent être cis (sur le même chromosome) ou trans (sur 2 chromosomes différents)
On peut les trouver dans la séquence référence du génome humain
Ont 100% d'identité entre elles
Ont 50% d'identité entre elles
Leurs taille fait à peu près 100 pb
Les segmental duplication conduisent à des réarrangements structurels et sont la cause de maladies génétiques
Fait parti d'une séquence non-codante unique
Minisatellite
Microsatellite
Pseudogène
Transposon
Fait parti des séquences répétées non-codantes du génome:
Les éléments régulateurs
Les fragments de gène
Les exons
Les pseudogènes
Minisatellite et microsatellite
Est faux concernant les pseudogènes:
Peut être réactivé
Contient des introns
Est riche en mutation
Ne contient pas de site de polyadénylation
Fait parti des séquences non-codantes intergéniques
La méthode intrinsèque d'annotation prédictive du génome:
Est une méthode probabiliste
Se base sur des similarités de séquence pour trouver de nouveaux gènes
Ne fait pas partie de la méthode intégrative
Est une méthode pour connaitre le nombre de transcrit du génome
Aucune de ces réponses
L'hétérochromatine facultative peut être activée au cours du cycle cellulaire
Est FAUX concernant les TADs
Les gènes d'un même TAD ont généralement un niveau d'expression similaire
Il y a + d'interaction inter-TAD que intra-TAD
Il peut y avoir une co-régulation de plusieurs gènes à l'intérieur d'un même TAD
Ils sont stables à travers différentes générations cellulaires
Les histones:
Peuvent subir un remodelage (un nucléosome peut être remplacé par un nouveau avec des variants d'histones)
Lorsqu'ils sont acétylé ils rendent la chromatine active (transcriptible)
L'acétylation des histones se fait sur des aa glycine
Leurs méthylation rend la chromatine non transcriptible
Un facteur de transcription pionnier (pioneer factor ou PF):
Est un des premiers facteur de transcription à avoir été découvert
Sont des facteurs de transcription se fixant sur les histones plutôt que l'ADN
Sont des facteurs de transcription qui n'ont pas de motifs de liaison
Lorsque il se fixe à son motif cela ne conduit presque jamais à un remodelage de la chromatine
Sont des facteurs de transcription qui peuvent se fixer sur leurs motifs même si ces derniers sont dans une chromatine compacte
Quel est le site préférentiel pour la méthylation de l'ADN chez les mammifères?
A
T
G
C
Toutes ces réponses
Quels sont les 2 ingrédients nécessaires pour une méthylation d'un C?
Une DNA déméthylase
SAM (S-Adenosyl-L-methionine Methyl donor)
DNMT (DNA méthyltransférase)
Une polymérase spécialisée dans la méthylation
Sont des processus biologiques où la méthylation d'ADN est impliquée SAUF:
Développement embryonnaire
NHEJ (Non-homologous end joining)
Inactivation du chromosome X femelle
Imprinting (empreinte parentale des gènes)
Transposition
La déamination d'une cytosine donne un uracil mais la déamination d'une 5-méthylcytosine donne une thymine
Est la raison pour laquelle la méthylation de l'ADN empêche la transcription:
Car les MBD (methyl-binding proteins) ne peuvent pas se fixer à l'ADN
Car la RNA polymérase II a accès à l'ADN
Car Cyril est apparu sur le brin d'ADN matrice
Car le groupe méthyl empêche les facteurs de transcriptions de se fixer à l'ADN
Car les pioneers factors ne peuvent pas se fixer à l'ARN
Est vrai concernant les maladies ayant des causes épigénétiques:
Le syndrôme de Rett est causé par une mutation dans MeCP2
Une mutation des histone acétyl transférase (HAT) conduit au syndrome de Rubinstein-Taybi
Le syndrome de Rett a souvent comme cause une mutation de novo
Des hypométhylations ou des hyperméthylations peuvent causer des cancers
