Analyse bioinformatique (Laurent)

Qu'est ce que le demultiplexing?

Qu'est ce que le phred score?

Lors d'un seq à quel moment la qualité du seq est la moins bonne?

Qu'est ce que prend en compte un algorithme de mapping (alignement de seq)?

Comment se passe l'alignement à la seq ref du géome?

Pendant l'alignement si il y a un A sur la seq de ref et un T sur notre seq il y aura un score plus faible que si on a un G sur notre seq?

Qu'est ce qu'un flag?

Qu'est ce que la notation CIGAR?

Qu'est ce que le format VCF ?

A quoi sert l'annotation?