Hankeln 2

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Flashcards on Hankeln 2, created by Alicia L on 17/09/2024.
Alicia L
Flashcards by Alicia L, updated about 2 months ago
Alicia L
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Resource summary

Question Answer
Was ist Genomannotation? Genorte finden und alle kodierenden Regionen (locate) Herausfinden was dieses Gen macht
Werden alle Gene in Proteine übersetzt? Nein, das Humangenom hat > 20 000 RNA Gene
Werden alle Genregionen proteinkodierender Gene in Proteine übersetzt? Nein es gibt auch untranslatierte Exons
Was ist alternatives Spleißen? Eukaryotische Gene werden nach Transkription alternativ gespleißt. Die mRNA-Spleißvarianten können unterschiedliche Proteine kodieren. (Eine mRNA, mehrere Proteine)
Wie sind unsere Gene struckturiert, warum wird dadurch die Gen Identifizierung bei EK erschwert? Mosaikgene aus vielen Introns und Exons Funktionelle Teile eines Gens sind als Schnipsel (Exons) verteilt (durchschnittliche Länge: nur 145 Basenpaare) => Nadeln im Heuhaufen
Was kann auf ein Gen hindeuten? Startkodons, Stopkodons > ORFS („open reading frames“) • Spleiß-Donor/Akzeptor-Stellen (“GT-intron-AG“) • Promoter: Bindemotive für Transkriptionsfaktoren („Boxen“) Startpunkt der Transkription (+1, cap site) CpG-Inseln • Polyadenylierungssignal (AATAAA) am Ende des Transkripts
Welcher Strang kodiert für ein GEn? Beide Stränge! manche Gene überlappen, dh.: beide Stränge der DNA kodieren dort
Wie sind Bakteriengene aufgebaut? in Operons Reihe von 2 oder mehr Genen und regulatorischen Sequenzen Proteine werden so koordiniert exprimiert und besitzen eng verwandte Funktionen
Wie liegen die Gene bei Viren vor? • Gene liegen sehr dicht gepackt • Gene können partiell überlappen • beide Stränge der DNA kodieren
Was sind die zwei Strategien der gensuche? DE NOVO Genvorhersage -> ich wende Allgemeinwissen an, wie Gene „gebaut“ sind DATENBANKSUCHE -> ich suche: gibt es woanders schon ähnliche Gene?
Was sind ORFs? Hypothese auf eine Potentielle Proteinkodierende Region Teil einer DNA Sequenz ohne Stop Codons, wobei Start Codons durchaus enthalten sein können Mit insgesammt 6 möglichen Frames (Sequenz aufgeteilt in dreier sets, nicht überlappender Triplets)
Welches Modell/Programm kann zur Genvorhersage benutzt werden? z.B.: Das Hidden Markov Model (HMM) hier werden tatistische Kenntnisse zur Architektur von Genen benutzt
Was ist das HMM verwende statistische Informationen, um Abfolgen (Reihe von ZUständen mit einer gewissen W'keit) (z. B. Sequenzen) zu klassifizieren
Was ist die Emissions, und was ist die Übergangswahrscheinlichkeit? Emission? -> W'keit für Base ACGT Übergangsw'keit? -> Übergang zu Base ACGT
Wozu dient das HMM? > Vorhersage der Genstruktur (Exons/Introns) > Vorhersage von Promoterbereichen
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