A partir del ADN ocurren los procesos en el organismo

Replicación del ADN
1. Descubrimiento de la estructura del ADN
  1. Primera ley de Chargaff
    1. Purinas con pirimidinas A-T, C-G
  2. Watson y Crick
    1. Distancia ente bases (0.34nm)
    2. Estructura helicoidal
    3. Distancia de repetición (3.4nm)
  3. Rosalind Franklin
    1. Cuasicristales de ADN
      1. Disfracción de rayos X
  4. Surco mayor y menor
  5. ADN-A y ADN-B (giro a derechas) ADN-Z (giro a izquierdas)
  6. ADN superenrollado
    1. Nucleosoma (Histonas+hélice)
2. Cinco ADN polimerasas
  1. 5' ->3'
  2. Fragmentos de Okazaki
3. Semiconservativa
4. Iniciación, elongación y terminación
  1. Replisomas y lazo en cremallera de replicón
  2. Horquilla de replicación
    1. Girada de ADN y proteínas de uniión a cadena sencilla
    2. RFC, PCNA, RPA, FEN-1
  3. Terminación con o sin telomerasa
5. Ciclo celular
  1. G0; Interfase (G1, S, G2); M(mitosis)
  2. Meiosis
  3. Coordinación con la replicación
    1. Procesos en cascada y activaciones mediante fosforilaciones
    2. Quinasas y ciclinas
Reparación del ADN
1. ADN dañado cambia a ADN mutado por reparación errónea
  1. Actividad autocorrectora de la ADN polimerada
2. Mutación del ADN
  1. Permite la evolución
3. Reversión directa del daño
  1. Fotorreactivación
  2. Desmetilación de guaninas
  3. Desmetilación de adeninas y citosinas
4. Reparación de daños en una cadena
  1. Reparación por escisión de base
    1. Mediante glucosilasa
  2. Reparación por escisión de nucleótidos
  3. Reparación de desapareamientos
    1. En procariotas
      1. Cadena mutada (desmetilada)
    2. En eucariotas
      1. Corte en 5' o 3'
  4. Reparación de roturas de cadena
5. Reparación de daños en ambas cadenas
  1. Unión de extremos no homólogos
  2. Unión de extremos microhomólogos
    1. Inserciones
    2. Deleciones
  3. Recombinación homóloga
    1. Procariotas
      1. RecBCD
    2. Eucariotas
      1. Reparación de cromosomas homólogos
      2. Reparación de roturas de doble cadena
      3. Modelo de unión doble de Holliday
      4. Apareamiento de cadena dependiente de síntesis
6. Tolerancia mediante síntesis translesión
  1. Polimerasas de ADN propensas a error
  2. Supervivencia a costa de más mutaciones
7. Respuesta SOS
  1. Reparación de emergencia propensa a error
8. Reparación y ciclo celular
  1. Sobrecruzamiento de cromosomas
  2. Recombinación homóloga
  3. Quinasas dependientes de ciclinas
  4. Puntos de control
Transcripción, procesamiento y maduración del ARN
1. Dogma central de la biología molecular
  1. ADN
    1. ARN
      1. Proteínas
2. Retrotranscripción
  1. Retrovirus
3. Más complejo en eucariotas que en procariotas
4. Circuitos de control de la transcripción
  1. Negativo (represor)
  2. Positivo (activador)
5. Transcripción
  1. Porcariotas
    1. Iniciación
      1. Factor sigma
    2. Elongación
      1. ARN polimerasa
    3. Terminación
      1. Terminador
      2. Dependiente o independiente de ro
    4. Regulación
      1. Operón lac (lactosa)
      2. araBAD de arabinosa
      3. Regulón SOS de respuesta de emergencia
      4. Operón trp (triptófano)
  2. Eucariotas
    1. Caperuza 5'
    2. Poliadenilación 3'
    3. Genes interrumpidos por intrones
    4. Ayustamiento
      1. El ARN como enzima
    5. Regulación
      1. Potenciadores (enhancers)
      2. Aisladores (insultors)
      3. Proteínas del unión al ADN
        Hélice-Giro-Hélice
        Dedos de Zinc
        Cremalleras de leucina
        Hélice-Lazo-Hélice
      4. Fcatores de transcripción
    6. Inicio, elongación y terminación
6. Degradación del ARNm
  1. Procariotas
    1. CRISPR-Cas (Bacterias)
    2. Degradosoma (Eubacterias)
    3. Exosoma de arqueas
  2. Eucariotas
    1. Interferencia /Silenciamiento
    2. Exosoma humano
Traducción de proteínas y procesos postraduccionales
1. Código genético
  1. Lenguaje de ADN/ARN a proteínas
  2. Severo Ochoa
2. Procariotas
  1. Ribosomas 70S (30+50)
  2. ARNm policintrónico
    1. Se traducen varias proteínas al mismo tiempo
  3. ARNm no madura
  4. Traducción
    1. Secuencia consenso de Shine-Dalgarno
    2. Polirribosomas
3. Eucariotas
  1. Ribosomas 80S (40+60)
  2. ARNm monocistrónico
  3. Maduración del ARNm
    1. Cola poliA
    2. Caperuza de 7-metilguanosina
  4. Traducción
    1. Activación de aminoácidos
    2. Intervención de ARNt
    3. Secuencia consenso de Kozak
    4. Polirribosomas y múltiples sitios de inicio
4. Plegamiento de proteínas
  1. Desnaturalización con urea/mercaptoetanol
  2. Renaturalización tras diálisis
  3. Chaperonas moleculas
    1. Plegamiento cotraduccional
    2. Hsp70
  4. Espontáneo
  5. Chaperoninas
    1. Plegamiento postraduccional
    2. Sistema GroEL/GroES (Hsp60/Hsp10)
5. Modificaciones postraduccionales (PTMs)
  1. Prenilación
  2. Glicosilación
  3. Etiquetaje de péptidos
  4. Oxidación
  5. Simulación por ordenador
6. Degradación de proteínas
  1. Lisosomas
    1. Mezcla de enzimas hidrolíticas
  2. Proteasomas
    1. Marcaje
    2. Captura y entrada
    3. Digestión
    4. Relación con el ciclo celular
      1. Estrés
      2. Supervivencia
      3. Apoptosis
      4. Senescencia
  3. Procesos en cascada
Transporte de proteínas
1. Envueltas celulares
  1. Procariotas
    1. Peptidoglucano(mureína)
      1. Biopelículas y comunicación por canales iónicos
        Gram +
        Gram -
2. En procariotas
  1. Reconocimiento de señal
    1. Ruta Sec
      1. Dependiente o no de SRP
      2. ATP como fuente de energía
    2. Ruta Tat
      1. Gradiente de protones como fuente de energía
3. Sistemas de membranas en eucariotas
  1. Delimitan orgánulos y compartimentos
  2. Por ellas se transportan sustancias
  3. Inserción de proteínas de membrana
    1. Péptidos con secuencia señal y de parada
    2. Proteínas modificadas (fosforiladas, glucosiladas)
4. En eucariotas
  1. Poros en la doble envuelta nuclear
    1. Transporte entre núcleo y citoplasma
      1. Proceso costoso con reacciones en cascada
      2. Gasto de energía en forma de GTP y a veces ATP
  2. Retículo endoplásmico rugoso(RER)
    1. Síntesis, modificación y transporte de proteínas
    2. Importación cotraduccional
      1. Energía en GTP
    3. Peroxisomas
  3. Aparato de Golgi
    1. Etiquetaje y empaquetamiento de proteínas
      1. Provienen del RER
      2. Endosomas y vesículas de secreción
        Lisosomas
  4. Flujos de membranas
    1. Ap. Golgi y RER transporte bidireccional
    2. Rreceptor de manosas 6P
    3. Proteínas de membrana
      1. Promueven el transporte de vesículas (clatrina)
  5. Mitocondrias
    1. Transporte y plegamiento asistido
    2. Transferencia de electrones y cadena respiratoria para energía
    3. Transporte matriz-espacio intermembrana
  6. Cloroplastos
    1. ATP como energía
    2. Transporte y plegamiento asistido
    3. Estroma y lumen de tilacoides
  7. Citoesqueleto
    1. Red de túbulos para el transporte
  8. Nanomáquinas
    1. Motores moleculares sintéticos

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