Zusammenfassung der Ressource
DETECCIÓN DE CROMOSOMAS ALTERADOS
- MÉTODOS
- MICROARRAYS (CMA)
- CARACTERÍSTICAS
- contiene clones genómicos en un ensayo de CGH
- incorporación de secuencias de ADN
- aumenta la resolución para detectar anomalías
- detecta más deleciones y duplicaciones que el análisis del cariotipo
- forma + fácil de identificar desequilibrios con mucha precisión
- adición de más sondas en todo el genoma (hasta 3 M)
- MAYOR RENDIMIENTO DIAGNÓSTICO
- USO DE SONDAS SNP
- en lugar de sondas oligonucleotídicas espaciadas
- agrega capacidades adicionales
- detectar alelo en específico
- detecta regiones con una pérdida de heterocifosidad
- detección de poliploidía para CMA prenatal
- desequilibrios citogenómicos se describen en función de
- coordenadas genómicas
- construcción del genoma de
las sondas utilizadas
- RECOMENDACIÓN DE LOS AUTORES
- prueba de diagnóstico de 1er nivel
- complementar con análisis de
cariotipo abreviado, bandas G o Fish
- en algunas indicaciones, las
bandas G deben usarse 1ero
- CMA no detecta reordenamientos balanceados
- Niños con trisomías autosómicas
deben tener análisis de cariotipo
- agregar a. de cariotipo cuando resultado de CMA
sea normal o necesite más información
- INICIO
- EN 2004. introducción junto a matrices que contenían clones de
BAC
- USO
- pruebas posnatales para investigar personas con
- discapacidad intelectual
- retraso en el desarrollo
- trastorno del espectro autista
- identificac de todas las aneuploidías y reordenamientos desequilibrados identificados por cariotipo
- en mortinatos (pruebas se obtienen con + frecuencia que con cariotipado)
- DEBILIDAD
- no puede detectar reordenamientos
equilibrados o algunos mosaicos
- ni define posición cromosómica de
segmentos insertados o eliminados
- REORDENAM QUE PASA POR ALTO:
traslocaciones, inversiones o inserciones
- MOSAICISMO:
- se debe combinar métodos luego de detección por otro método
- FISH + CMA
- la constitución cromosómica depende de la población celular que se estudia
- DEFINICIÓN
- cuando se tiene dos o más poblaciones de células que difieren en su composición genética.
- a veces se necesita cariotipo para
interpretación completa
- no distingue trísomias de
traslocaciones robertosianas
- Tecnologías citogenéticas
moleculares tempranas
- FISH
- cromosomas en metafase: células del paciente.
- Sondas de ADN marcadas con fluorescente derivadas de ADN genómico normal
- mayor resolución para detectar desequilibrios específicos
- USO DESDE 1980
- ANÁLISIS DE:
- anomalías submicroscópicas
- microdeleciones, duplicaciones, desequilibrios
o reordenamientos teloméricos
- VENTAJA
- resultados rápidos para aneuploidías, traslocaciones
desequilibradas, análisis de una célula y secciones de parafina
- 1era prueba de diagnóstico
para sospecha de estas
- brinda info de posición cromosómica y número de copias
- validación de resultados de CMA
- CGH (TRADICIONAL)
- cromosomas en metafase: células de control normales
- hibridación comparativa de 2 muestras de ADN (1
muestra de prueba+1 muestra de referencia normal)
- parecido al análisis con bandas G= analiza
todo el complemento genómico
- más útil en citogenética del cáncer
- ADN de células tumorales
- identifican desequilibrios indetectables bajo microscopio
- combinación de métodos citogenéticos y basados en ADN
- NUEVOS
MÉTODOS
- SECUENCIACIÓN NO
DIRIGIDA DEL GENOMA
COMPLETO (WSG)
- es una metodología de alta resolución
- Podría reemplazar la mayoría de técnicas. Por el momento no es práctico
- PARA ANALIZAR:
- reordenamientos cromosómicos equilibrados
- reordenamientos aparentemente equilibrados
asociados con cambios de secuencia en puntos de corte
- DEBILIDAD:
- se desconoce que traslocaciones permanecerán verdaderamente equilibradas
- y qué proporción será verdaderamente patógena
- DETECCIÓN PRENATAL NO INVASIVA
- DETECCIÓN DE ANEUPLOIDÍAS
CROMOSÓMICAS
- se basa en detección de ADN fetal libre
de células en el plasma materno
- DATOS CLAVE
- Complemento cromosómico humano haploide: 3K M de pares de bases
- 1 BANDA= 6Mb de ADN
- BANDAS G Y FISH: deleciones son más fáciles de detectar que duplicaciones
- 5 A 10Mb es aprox el límite de detección para una deleción o duplicación
- OBSERVACIONES DE LOS AUTORES
- WGS Y CRIBADO PRENATAL seguirán evolucionando
- probablemente remplacen al CMA
- CNV: CLASIFICACIÓN
- A. PATÓGENO
- B. INCIERTO
- probablemente patógeno
- C. INCIERTO
- D. INCIERTO
- probablemente benigno
- MI: benigno