Síntesis de RNA mensajero en Eucariontas.

Es llevada a cabo por la RNA Polimerasa II .
1. Transcribe el mRNA.
2. Se une al promotor con la coperación de varios factores generales de transcripción (GTF), para formar un complejo de preiniciación PIC.
Generalidades.
1. Participan elementos reguladores trans.
  1. Una gran variedad de proteinas (factores de transcripción).
2. Requiere de un promotor.
  1. Conformado por diversas secuencias río arriba (elementos cis).
    1. Promotores (Caja TATA, CAAT y CpG).
      1. Caja TATA.
        Secuencia consenso.
        Regula y determina el inicio de la transcripción.
        Se encuentra entre 24 y 35 base en dirección 5'.
      2. Caja CAAT y Caja GC.
        Se localizan dentro de 100 a 150 pb en dirección 5'.
        Sitio de TF (NF1 y SP1).
        Regulan la frecuencia en que la polimerasa transcribe el gen.
3. Participan elementos regualdores cis.
  1. Intensificadores.
  2. Silenciadores.
  3. Promotor.
4. El mRNA requiere maduración previa a la traducción.
5. Requiere remodelación de la cromatina.
Iniciación.
1. Unión de la proteina de unión a la caja TATA (TBP).
  1. EL TBP es una subunidad de un complejo más grande TFIID.
    1. TFIID factor de transcripción para la polimerasa II.
      1. Su unión permite el ensamble del complejo de preinicio completo PIC.
        TFIIA estabiliza la interacción entre TBP Y el DNA.
        TFIIB provee un sitio de unión para la RNA pol.
        La unión de estas tres proteinas permite la unión de la enorme multisubunidad.
        El TIIF contiene una subunidad homóloga al factor sigma bacteriano.
        Una vez en posición permite la unión de otros factores TFIIE y TFIIH.
        TFIIE recluta a TFIIH y a su actividad helicasa y cinasa.
        Una vez que la trasncripción comienza algunos GTF (incluidos TFIID) pueden permanecer en el promotor mientras otros se liberan del complejo.
        Mientras más tiempo permanezca la TFIID unida al promotor, más moleculas de RNA pol pueden unirse al promotor e iniciar nuevos procesos de transcripcción.
        Activación de la RNA Polimerasa II.
        La subunidad más grande de la RNA Pol es un dominio carboxilo terminal CTD.
        Este dominio consiste en 7 aminoácidos(-Tyr1-Ser2-Pro3-Thr4-Ser5-Pro6-Ser7).
        Las serinas 2 y 5 son las principales candidatsas a fosforilar.
        La proteína TFIIH fosforila Ser5.
        Puede actuar como el desencadenante que desacopla la enzima de GTF, DNA o promotores.
        La RNA Pol escapa del complejo de preiniciación.
        P-TEFb fosforila CTD en Ser2, conforme RNA Pol se desplaza.
        SII ayuda a pol a moverse después de una pausa
        ELL se une a la RNA Pol aumentando su afinidad por los factores de elongación I y II
        En humanos se repite 57 veces el heptapéptido.
        Cuando está ensamblada con el complejo de preiniciación no está fosforiliada.
        RNA polimerasa II comprometida con la transcripción está muy fosforiliada
  2. Su interacción dobla el DNA cerca de 80 grados permitiendo la interacción de otros factores.

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