En la antigüedad se pensaba que pertenecían al reino de las plantas, con el descubrimiento del microscopio se demostró que carecen de cloroplastos, no realizan la fotosíntesis, son heterótrofos, la pared de sus células está compuesta por quitina y no por celulosa, por lo que se llegó a la conclusión de que pertenecen al reino FUNGI.Muchos hongos son beneficiosos y tienen importancia económica por ej. las levaduras: pan, yogurt, cerveza; algunas setas se consumen crudas o cocidas; el Penicillium notatum es fuente de extracción de antibióticos.
Los hongos parásitos causan enfermedades (vegetales, animales, otros hongos).De acuerdo con la relación de los hongos con el hospedero se clasifican en:Biotróficos: Obtienen los nutrientes directamente de las células vivas.Necrotróficos: Primero destruyen la célula y luego absorven los nutrientes.