1. La degradación
específica y el
fraccionamiento de los
polinucleótidos a
fragmentos pequeños
2. La secuenciación
de los fragmentos
pequeños
3. El uso de un
procedimiento de
degradación que
produce una serie de
fragmentos de
polinucleótidos que
traslapan el punto
de corte en la serie
Historia
Inicialmente se secuenció usando método
similares a los usados para secuenciar proteínas
F. Sanger et al.
desarrollaron
técnicas de
fraccionamiento
más rápidas y
simples para
secuenciación de
ARN y ADN.
Más adelante
desarrollaron un
método más
eficiente: el
enzimático
Luego de 1975 hubo
avances
significativos
-Descubrimiento de
enzimas que cortan el
ADN en secuencias
específicas. -Técnicas de
clonación para
secuenciar segmentos
de ADN
Métodos
Degradación química
(Maxam & Gilbert, 1977).
Puede determinar la
secuencia desde la primera
base. Es el más adecuado
para determinar la
secuencia de fragmentos
cortos.
Los fragmento de ADN separados se unen
por electroforesis. Las reacciones químicas
en este proceso son las siguientes: 1) Corte
de purinas. 2) Corte de adeninas. 3) Corte de
pirimidinas. 4) Corte de citosina.
Método enzimático (Sanger et
al., 1977). Consiste en la
utilización de la molécula ADN
polimerasa para sintetizar
cadenas de ADN con
terminación específica.
Se llevan a cabo cuatro reacciones con
ddNTPs diferentes para que se
sinteticen distintos fragmentos que
puedan ser separados con
electroforesis y poder determinar la
secuencia del tempaldo.
Secuenciación
contemporánea
Reacción en cadena de
la polimerasa (PCR):
Permite la amplificación
exponencial del ADN, produciendo
millones de copias de un
fragmento. Se genera gracias a la
acción de los oligonucleótidos ya
que contienen un extremo 3`libre
que es complementario con la
cadena molde del ADN.
Este proceso consta de tres pasos: 1)
Desnaturalización de las hebras de
ADN. 2) Temperatura de
alineamiento. 3) Extensión de la
cadena de ADN.
Polimerasa Taq:
Permitió automatizar la reacción
de PCR, sin tener que adicionar
enzimas nuevas en cada reacción,
debido a que resiste altas
temperaturas
Fue aislada de la bacteria
Thermus aquaticus
Marcaje del ADN:
Se realiza mediante la utilización de fluoróforos, debido
a que el trabajo con isótopos radioactivos utilizados
anteriormente, es demorado, costoso y peligroso
Adicionalmente las
moléculas
fluorescentes
contribuyen a la
automatización de la
secuenciación de los
ácidos nucleicos.