Criado por David Vásquez Cerqueda
aproximadamente 8 anos atrás
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Questão | Responda |
Unidad No. 4 Diseño de compuestos activos basado en el receptor Elaborado por: Vásquez Cerqueda I. David | FIN |
¿Qué es docking? Búsqueda del modo de unión preferido del ligando en un complejo ligando-receptor | . |
Posibilidades del docking Elucidar mecanismo de acción Optimización de la actividad | . |
Se necesita... -Estructura del ligando -Estructura de la diana biológica | . |
Ejemplos de bibliotecas químicas comerciales ZINC MDL CHEMSTAR | . |
Programas para hacer docking Glide AutoDock Dock FRED | . |
Consideraciones para el ligando Estado de protonación, tautomerismo y flexibilidad durante el docking | . |
Etapas del docking 1 Búsqueda 11 Cálculo de energía (scoring) | . |
Validación de protocolos de Docking Reproducir coordenadas de ligando, si es que hay (RMDS) Modo de unión reportado | . |
Post-procesamiento Selección automatizada -Ranking -Score | . |
Eliminar falsos positivos Consensus Docking Consensus scoring | . |
En qué no es tan bueno el Docking En el scoring | . |
Complicaciones del diseño de NOVO La síntesis del compuesto puede ser dificil | . |
Desventajas del diseño con base a fragmentos Es necesaria la caracterización estructural, más costoso La síntesis para unir fragmentos puede ser complicada |
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